利用SSR和四个测序水稻品种构建分子图谱及QTLs分析-作物遗传育种专业论文.docxVIP

摘 摘 要 大多数衣作物性状是由多基因控制的数量性状，对数量性状基因位点进行鉴定在作 物遗传育种上具有重要意义。尤其是用全基因组完成测序的材料进行数量性状的研究， 为进一步开展QTL功能解析奠定坚实的基础。本研究选用两个全基因组测序已经完成 的材料籼稻93．11和粳稻日本晴(Nipponbare，本研究中简写为NIPP)，以及进行了部 分测序的光温敏两用不育系PA64S和完成了第4染色体全序列测序的籼稻广陆矮4号 (本研究中简写为GLA)，进行两两组合，共构建了6个F2遗传群体，利用SSR标记 进行了遗传连锁图谱的绘制，并对株高、抽穗期、千粒重等14类重要农艺性状进行了 QTL定位分析，其主要结果如下： 』 1．用756对水稻SSR引物在四个亲本材料间进行了多态性分析，结果表明：日本晴与 93。11、GLA和PA64S之间的多态性频率分别为33．07％、30．56％和23．81％：PA64S 与93．11和GLA之间的多态性频率分别为19．44％和18．52％；93．11与GLA之间 的多态性频率为11．24％。亲缘关系越近，两者之问的多态性越小。 2．利用4个测序水稻品种进行两两杂交构建了6个F2遗传群体(PA64S／9311-F2， PA64S／Nipponbare—F2，PA64S／GLA-F2，NIPP／9311-F2，NIPP／GLA—F2和9311／GLA—F2)， 并用SSR标记绘制了6张分子连锁图谱。在这6张图谱上定位的SSR标记数、覆 盖基因组长度(cM)争标记闻平均遗传图距(cM／marker)分别为：74，1204，18．27； 89，1400．4，15．73；89，1331．9，14．87；117，1670．7，14．28；108，1224．6，11．34；53， l】30．6，21．33。 3．由本实验室自行开发设计的SSR标记(编号为RP撑系列)，有90对被分别标定在上 述6张连锁图谱上，其中在PA64S／9311上有22对，PA64S／Nipponbare上有44对， PA64S／GLA上有19对，NIPP／931 l上有41对，NIPP／GLA上有46对，931 1／GLA 上有4对。 4．利用QTL区间作图法对株高、有效分蘖数、千粒重、抽穗期、穗数等14类水稻农 艺性状进行了QTL定位，共检测到130个QTLs，其中在PA64S／9311．F2(包含其 F2：3家系)，PA64S／Nipponbare—F2(包含其F2 3家系)，PA64S／GLA—F2，NIPP／9311．F2， NIPP／GLA—F2和9311／GLA．F2等6个群体上分别检测到16、23、17、38、25和11 个QTLs。在6个群体中所检测到的49个主效QTLs如下： ①在PA64S／9311-F2(包含其F2 3家系)群体中检测到的主效QTLs有7个：2个株 高QTLs f qphl，31．6％；qph2，29．4％)；1个穗长QTL(qpll，31．4％)：2个剑 叶长QTLs(卵』，22．7％；妒2，21．8％)和2个分蘖数QTLs(qtn2，21．6％；qm3， 35．5％)。②在PA64S／Nipponbare-F2(包含其F2：3家系)群体中检测到的主效QTLs有8个：1 35．5％)。 ②在PA64S／Nipponbare-F2(包含其F2：3家系)群体中检测到的主效QTLs有8个：1 个有效分蘖数QTL(qetn2，31．3％)；1个穗数QTL(qpn3，34．4％)；3个剑叶长QTLs (qfl2，48．7％；qfl3，53％；q)q4，66．8％)；1个结实率QTL(qssl，51．8％)；1个千 粒重QTL(qkw2，29．5％)和1个株高QTL【qphl，32％)。 ③在PA64S／GLA-F2群体中检测到的主效QTLs有4个：2个分蘖率QTLs(qptl， 72．5％；qpt2，72．9％)和2个株高QTLs(qphl，20．5％；qph5，32．6％)。 ④在NIPP／931l-F2群体中检测到的主效QTLs有18个：3个分蘖率QTLs(qptl，63．1％； qpt3，64．6％；qpt4，29％)；3个株高QTLs(qphl，41．5％；qph3，20．3％；qph：t， 26．7％)；2个主穗长QTLs(qmpl3，27．7％；qmpl4，24．3％)；2个抽穗期QTLs(qhdl， 25％；qhd2，27．9％)；1个稳长QTL(qpl4，20．6％)；4个剑叶长QTLs(q∥，，22．8％； qfl2，21．4％；妒4，29．1％；强加，25．4％)和1个穗数QTL(qpn4，22．1％)。 ⑤在NIPP／GLA—F 2群体中检测到的主效QTLs有8个：1个分蘖数QTL(qt