两个小麦ERF类转录因子基因的表达分析及作物ERF类转录因子的电子克隆-生物化学与分子生物学专业论文.docxVIP

from Sorghum bicolor ,were cloned by in silico cloning and termed as HvERFL1, SbERFL1, SbERFL2.Cloning in silico based on the corresponding EST sequences from EST database in NCBI. Bioinformatics analysis revealed HvERFL1, SbERFL1, SbERFL2 contain a complete ORF and conserved AP2/ERF domain. Some characters of amino acids encoded of HvERFL1, SbERFL1, SbERFL2 genes, including the composition of amino acid sequence, physical and chemical properties transmembranedomain, hydrophobicity/hydrophilicity, subcellularlocalization, secondary and tertiary structure of protein plus the functional domain, were analyzed by bioinformatics tools. Bioinformaticanalysis showed that the aminoacid encoded by HvERFL1, SbERFL1, SbERFL2 genes were highly homologous with those encoded by ERF transcription factor genes in rice, maize, Arabidopsis thaliana, Triticum aestivum. The above results will provide the basis for molecular cloning of ERF transcription factor genes in crop． Key words: wheat, ERFs transcription factor, stress resistance, gene expression, In silico Cloning 目 录 第一章 引言1 1.1 AP2/ERF 转录因子研究进展 2 TOC \o 1-2 \h \z \u 1.1.1AP2/EREBP 类转录因子概述 2 1.1.2 AP2/ERF 类转录因子的生物学功能 3 1.2 ERF 亚族转录因子研究进展 4 1.2.1 ERF 转录因子概述 4 1.2.2 ERF 类转录因子在植物生物和非生物胁迫应答中的作用 5 1.3 植物中含 EAR 基序的转录抑制子 6 EAR-motif 概述 6 ERF 亚族中含 EAR-motif 转录抑制子功能分析 7 1.4 本研究的目的及意义7 第二章 小麦两个 ERF 类转录因子的生物信息学分析8 2.1 材料与方法8 2.1.1 数据来源8 2.1.2 生物信息学分析8 2.2 结果与分析8 2.2.1 两个小麦 ERF 类转录因子编码氨基酸一级结构及疏水性/亲水性预测 8 2.2.2 两个小麦 ERF 类转录因子蛋白磷酸化位点预测与信号肽预测 12 2.2.3 两个小麦 ERF 类转录因子亚细胞定位分析及蛋白跨膜结构域预测 13 2.2.4 两个小麦 ERF 类转录因子二级结构的预测及保守结构域的分析 14 2.2.5 两个小麦 ERF 类转录因子蛋白质三维结构预测 15 2.2.6 两个小麦 ERF 类转录因子氨基酸同源性分析及进化树的构建 16 2.3 讨论19 第三章 小麦两个 ERF 类转录因子的表达谱20 3.1 材料与方法20 3.1.1 材料与试剂20 3.1.2 主要实验仪器20 3.1.3 试验方法20 3.2 结果与分析23 3.2.1 小麦总 RNA 的提取 23 3.2.2 两个小麦 ERF 类转录因子的表达谱分析 23 3.3 讨论28 第四章 小麦两个 ERF 类转录因子转基因烟草的研究30 4.1 材料与方法30 4.1.1 材料与试剂30 4.1.2 主要实验仪器30 4.1.3 试验方法30 4.2 结果与分析32 4.2.1