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- 2019-05-26 发布于上海
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摘要杂草稻又名杂草型稻或杂草种系,在美国又被称作红米(red
摘要
杂草稻又名杂草型稻或杂草种系,在美国又被称作红米(red rice),它广泛 分布于温带、热带地区,甚至一些没有野生稻存在的地区,如美国、欧洲等地。 杂草稻具有杂草的一些特性,存在于栽培稻田中影响水稻的产量和质量。中国作 为世界上主要的稻作生产区之一,近年来由于直播与轻型栽培等技术的推广,杂 草稻的危害已日趋严重。辽宁作为中国的主要水稻产区之一也同样存在着这样的 问题。本文通过对辽宁杂草稻的RAPD及SSR分析,研究了辽宁杂草稻的遗传多 样性及群体分化情况,获得了以下一些主要结论:
1.所分析的20个随机引物共扩增出了109条带,但是只有引物S303、S4 出现4个多态位点,多态性位点所占的比例(P)只有3.7%。辽宁杂草稻总体的 等位基因观察值(Na)、有效等位基因数(Ne)、基因多样性指数(h)、Shannon 多样性指数(,)分别为1.0370、1.0201、0.0111、0.0168。采用的21对SSR引物 中只有10对引物能在40个辽宁杂草稻样品中的扩增出多态的产物,多态位点所 占的比例约为47.62%,其Shannon多样性指数(,)为0.2902、期望杂合度(He) 为0.0393。与以往利用SSR及RAPD在研究水稻遗传多样性的结果相比,辽宁 杂草稻基因多样性很低。
2.根据RAPD与SSR获得的辽宁杂草稻的群体分化系数(Gst值)分别为
0.8849和0.6660,表明辽宁杂革稻约有2/3的变异来自于群体间。RAPD结果的 AMOVA分析显示群体间变异占总变异的92.31%,特别是地区间的变异尤为明显 (占总变异的95.49%),地区间的分化达到了极显著水平(P0.001)。分析的21 个SSR位点中共有10个是多态位点,其中4个位点上(占40%)沈阳与丹东两 地的杂草稻有各自特异性的等位基因。这些均说明辽宁杂草稻各群体之间的分化 程度较大,特别是丹东与沈阳两地之间的分化更为明显。
SSR及RAPD两种分子标记比较分析的结果表明,虽然这两种分子标记在分 析辽宁杂草稻遗传多样性及群体分化时得到了基本一致的结论,即多样性较低但 群体间分化特别是地区间分化较大。但在其他方面如Gst值、沈阳与丹东两地杂 草稻的遗传多样性比较以及对丹东杂草稻3个居群的聚类上出现了分岐。这种分 岐与SSR及RAPD,特别是RAPD揭示出的极低多样性以及这两种分子标记本身 的特征有关。
关键词:杂草稻(Oryza sativa L.)、遗传多样性、群体遗传结构、RAPD、SSR
AbstractWeedy
Abstract
Weedy rice,which is also called red rice in USA,occurs in all the major rice growing areas in the tropics,even in the areas where no wild relatives of rice occur,such as the USA and Europe.With some characteristics like weed.weedy rice in the rice field will diminish farmer income both quantitatively through yield reduction,and qualitatively,through lowered commodity value at harvest.China,one of the main rice—planted counties,is facing a more and more serious rice production problem of weedy rice for the extensive use of technologies like direct seeding and simple transplant in the recent years.Liaoning province,as one of the main rice production regions in China,is also facing similar problems.In the present paper,
we investigated the genetic diversity and structure of Liaoning weedy rice by the molecular markers of SSR(Simple Sequence Repeat)and RAPD(Random Amplified Polymor
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