卤虫Hox基因家族abdA基因与Dfd基因序列差异及其系统进化关系的研究-海洋生物学专业论文.docxVIP

卣虫Hox基因家族abdA基固与Dfd基因序列差异及其系统进化关系的研究卤虫Hox基因家族的洲基因 卣虫Hox基因家族abdA基固与Dfd基因序列差异及其系统进化关系的研究 卤虫Hox基因家族的洲基因 与口剜基因序列差异及其系统进化关系的研究 研究生：陈志娟 指导教师：侯林教授 专 业：海洋生物学 研究方向：海洋动物细胞生物学 中文摘要：卤虫(Art船Ja)属于甲壳纲(Crustasen)，鳃足亚纲(Branchiopoda)，无甲 目(Anostacea)，卤虫科(Artemidae)，卤虫属(Artemia)．通常分布于内陆盐湖和海岸 盐田中。卤虫分为两性生殖和孤雌生殖两大类，目前世界上比较有说服力的分类方法是把 世界上的两性生殖卤虫分为6个种，分别为：正fzanciscan岛A persimili五丘monic 丘ormian吕，丘siMca,A tenisYar碹。把世界各地的孤雌生殖卤虫定名为孤雌卤虫复合 种正婵r拍enogenetica。随着分子生物学技术的发展。分子进化已经成为近年来进化生物 学研究中的—个重要方面。本文采用Pcl}直接测序方法首次对11个地区的两性生殖卤虫和 10个地区的孤雌生殖卤虫的Hox基因家族中的abdA基因和Dfd基因序列进行了测定，用 ClustalXl．8软件对比并用船GA2．1软件分析其碱基组成及变异情况．abdA基因以红蚂蚁 Oecophyl妇Longinoda作为外群构建分子系统树，Dfd基因以家蚕Nereis作为外群构建分 子系统树。经对位排列后，两性生殖卣虫的abdA基因部分序列均包括304个碱基，含有31 个变异位点，种问序列差异值为0．8％-8．o{6；Md基因部分序列包括401个碱基，含23 个变异位点，种间序列差异值为隅～4，3％之间．孤雌生殖卤虫a6洲基因部分序列均包括304 个碱基，含有23个变异位点，种问序列差异值为4．o％～5．7％两个基因均未见有插^和 (或)缺失。论文中还比较了8个地区卤虫品系的8矧基因序列，其中含有30个变异位 点，种间序列差异值为1．5％～7．鼢。根据p-dlstance模型，构建HJ树、砸树，基于abd4基 因与Dfd基因部分序列分别重建的系统树都将11个地区的两性生殖卤虫分为四个种： t frarmiscan、且persimi』j正urfaiana、丑sinica．J蔚属于丘franciscan的GSL和SFB 聚到—起，五flx口cJscan和正persimills聚到—起，因此，二者间的亲缘关系比较近， 来自西藏的如和OXC聚在—起，来自哈萨克斯坦的卤虫与西藏卤虫亲缘关系比较近，来自 内蒙吉的3个地区的卤虫聚在_起，运城的卤虫与内蒙古的卤虫聚在_起，而来自伊朗的 t urmiana处于西藏和内蒙卤虫之间。孤雌生殖卤虫分为两支，内陆和沿海地区。其中内 皤这一支中新疆和青海的卤虫先聚在一起，而内陆其他三个地区的卤虫聚在一起。 是键词：卤虫；石胡基因：明基因：分子进化 3 卤虫／／ox基因家族abdA基因与Did基因序列差异及其系统进化关系的研究1前言 卤虫／／ox基因家族abdA基因与Did基因序列差异及其系统进化关系的研究 1前言 形态分类研究中，由于存在趋同进化等因素的干扰，使不同的分类学家对动物形状的 看法不一致，因而许多分类学问题长期得不到解决uJ，这种问题也存在于卤虫分类学研究 中。虽然有关囟虫分类的许多有意义的结果是从形态结构、生理特征及分子手段中得出的， 但由于许多客观因素的限制，使得传统的分类学方法有时并不能足戬解决分类和系统进化 中的一些疑点。相对而言，这些问题在分子系统学中可以得到解决吲。DNA不仅是主要的 遗传物质，同时也是生物进化史的重要记录者，在研究生物的进化历程，确定物种间的进 化关系等方面，DNA序列具有易于分析，含有丰富的进化信息和易于获取等优点【3J。因此， 从基因组DNA角度为卤虫的分类及进化提供一些新的资料是十分必要的。本文分析了近 几年来国内外有关卤虫分类的研究概况及进展，初步尝试论述卤虫Hox基因家族中的abdA 基因和Dfd基因序列差异在卤虫分子进化研究中的适用性，对两性生殖卤虫和孤雌生殖卤 虫的系统发育进行了初步的探讨。 1．1Hox基因家族概述 动物胚胎前后轴(anterior-posterioraxis)卣许多不同类型的细胞组成，胚胎中有一个 复杂的遗传系统通过相应的信号指挥胚胎发生。这个系统的中心由一套结构相似的基因组 成，称为同源异型基因(homeotlcgene,Hox)。Hox基因，又称同源异型基因(homiodcgene)， Hox基园家族是成簇存在的同源异型盒基因，具有一段长约18曲p的同源序列。它所编码 的60个氨基酸构成螺旋转角，螺旋结构的同源结构