凉山半细毛羊1号染色体遗传连锁图和羊毛性状QTL定位研究-动物遗传育种与繁殖专业论文.docxVIP

四川农业大学硕士学位论文 四川农业大学硕士学位论文 凉山半细毛羊I号染色体遗传连锁圈和羊毛性状QT兰窒垡里堕 摘要 本研究用凉山半细毛羊的8个父系半同胞家系的245个后裔组建成的资源参考群 进行了1号染色体遗传连锁图的构建和部分羊毛性状QTL初步定位。实验共计检测了 387个个体的9个微卫星标记的基因型数据。各个标记的群体平均等位基因数为8．44 个；平均杂合度H=0．617：平均多态信息含量PIC=O．604，其中有7个标记表现高度多 态性(PIC／0．5)。说明试验所用的标记具有丰富的多态性，可以用于连锁图谱的构建 和QTL定位分析。用于QTL分析的性状为断奶羊毛纤维长度(BMC)、断奶羊毛纤维 细度(BXD)、育成羊毛纤维长度(CMC)、育成羊毛纤维细度(CXD)、育成腹部羊毛 纤维长度(cFM)、育成剪毛量(CJML)、成年羊毛纤维长度(DMC)、成年羊毛纤维 直径(D)①)、成年腹部羊毛纤维长度(DFM)、成年剪毛量(DJML)等。 历构建的凉山半细毛羊l号染色体的遗传连锁图，总长311,0cM，9个微卫星标记 平均间距为38．9cM。连锁图中最小的间距为BM6465与BMSl636之间(17．8cM)； 最大间距为标记MCM58和标记BMS2321之间(58．8cM)。 对试验群体的245个后裔及其亲本的毛性状进行了测量和表型分析。各性状间相关 分析结果表明，BMC与CMC、CMC与DMC之间极显著相关，CMC与CJML、DMC 与DJML之间显著相关。各性状在不同家系和年龄主效应下的方差分析结果：家系效 应对BMC和CMC影响极显著(PO．01)，对DMC、DFM、DJML有显著影响(P 0．05)。对CFM、CJML和DXD影响不显著；年龄因素对BMC的影响显著(P0．05)。 对CJML、DJML、DMC和DXD影响极显著(P0．01)，而对其余的性状无显著影响。 用两种不同的软件对羊毛性状进行QTL分析的结果表明，共同检测达到显著水平 的是CMC和CXD的QTL，但具体位置有所差异。用QTL Express检测的结果，影响 CMC的一个QTL位于标记BMS2321和标记BM6506之间的215cM处，而用Win QTL 分析结果，该QTL则位于BM6506标记的231．6cM处，虽然存在一定差异，但还是在 估计的95％的QTL置信区间范围内(201．5 cM～261．9cM)，与标记BM6506相连锁， 具有一定的可靠性。影响CXD的QTL在两个作图软件分析结果中差异较大，其中QTL Express的分析结果是位于标记BMS835和BMS2145间的13cM处，而在Win QTL分 析的结果中位于标记BMS2321和标记BM6506间的203．1cM位置上，造成该结果的原 因有待进一步研究。此外，在其中的一个软件的分析结果中达到0．05显著水平的QTL 还有：BMC在191家系有1个QTL(260cM)；CJML有3个0TL：189家系(249cM)、 191家系(247cM)、192家系(185cM)；DJML有1个QTL，192家系(59cM)： CFM在190家系中检测到1个QTL(0．0cM)：DMC和DXD在同一个家系的同一个 位点检测到了1个OTL，187家系(66．1cM)。 关键词：遗传连锁图；QTL：凉山半细毛羊；羊毛性状 璺型查兰兰查兰堡圭堂垡堡苎 璺型查兰兰查兰堡圭堂垡堡苎 堕尘兰塑墨兰!兰墨皇竺望堕苎塑里塑苎墨堡鉴g翌塞垡竺塞 A primary genomic screen for quantitative trait loci(QTL)affecting wool traits was performed by analyzing 9 microsatellites within 245 progeny from 8 half-sib families of Liangshan semi-wool sheep．A total of 387 individuals wem genotyped for all markers．nIe average number of alleles was 8．44．the mean observe heterozygosity Was 0．643。and the average PIC was O．604．7 of9 microsatellites are hi曲ly polymorphic(PICl0．5)．Therefore these markers could be used to the construction of linkage ma