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摘
摘 要
本研究利用绵羊基因组中2号染色体上的13个微卫星(Microsatellite)标记
(OarFCB0226,BMS0887,BMSl341,BMS678,BMSl591,OarCP0079,OarFCB20,BMS
1126,BMS2626,BM6444,BMS0356,BMS2113,OarFCBll),对凉山半细毛羊群体在 这13个微卫星标记座位上的等位基因频率、微卫星的多态信息含量(PIC)、群 体的杂合度(Heterozygosity)进行了分析,并对微卫星标记应用于群体遗传多 样性研究方面存在的问题进行了探讨。
实验结果表明,所选择的13个微卫星标记在凉山半细毛羊群体中表现出良 好的多态性,每个微卫星标记平均检测到11.1个等位基因(5-18个),13个微 卫星标记的平均多态信息含量(PIC)为O.609(0.309~0.825),平均杂合度为0.504 (O.408~0.549)。微卫星的多态性和Genbank中的结果存在差异,其原因可能是 实验群体和群体大小的差异所引起的。
凉山半细毛羊不同群体的各项指标差异不大,所计算的群体内较高的杂合度 表明其遗传多样性比较丰富,而且具有较高的选择潜力。这些结果与根据形态学 及育种历史等进行的预期结果基本一致,表明微卫星标记适宜于群体遗传结构的 研究,是畜禽遗传多样性研究与保护的有效分析手段。各群体由不同微卫星标记 所反应的群体杂合度具有较大的差异,如对于整个群体而言,微卫星标记 BMSl591检测出的结果H=0.052,而用微卫星0arFCB20检测出的结果H=0.863, 说明采用少量的遗传标记进行群体杂合度的检测,其结果并不一定能够反应出群 体的真实情况,为了使实验结果更加准确,应对使用的分子标记进行适当筛选, 并尽量研究更多位点的变异,以获得基因组遗传变异更加全面的信息。在畜禽育 种工作中,对数量性状进行QTL定位和标记辅助选择(MAS)的首要工作是寻 找与决定某一性状的QTL相连锁的各种多态性好、重复性好的分子标记,本实 验也为凉山半细毛羊群体一些重要生产性状的QTL定位奠定了基础。
关键词:凉山半细毛羊 微卫星标记 遗传多样性 杂合度
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1 文献综述
1.1畜禽遗传多样性及其研究水平
1.1.1遗传多样性的概念
生物多样性(Biodiversity)是指生物及其环境形成的生态复合体以及与此相 关的多种生态过程的总和。它包括数以百万计的动物、植物、微生物和它们所拥 有的基因以及与生存环境形成的复杂生态系统,分为遗传多样性(基因多样性)、 物种多样性、生态系统多样性和景观多样性四个层次。
遗传多样性(Genetic diversity)是生物多样性的基础和核心,与生物多样性 的形成、发展和消失密切相关。遗传多样性主要指种内基因组的变化,包括种内 不同种群和同一种群内的遗传变异,也称为基因多样性,具体表现在种内或种间 外部形态结构、核型特征(染色体数目、形态、分带特征等)、基因表达产物(各
种蛋白质、多肽)以及DNA分子水平上的多态性。遗传多样性最直接的表达形 式就是遗传变异的高低,通常包括遗传变异的分布格局,即群体的遗传结构 (Millar,1991)。在生物内部生存环境的不同也会产生遗传上的多样化,各种生 物不同亚种或地方品种都存在着丰富的遗传多样性,它是物种各个水平多样性的 主要来源。
1.1.2遗传多样性研究的意义
物种或群体的遗传多样性是长期进化的产物,也是其生存、发展的基础。遗 传多样性的存在是自然选择和生物体自发突变动态平衡的结果,经过选择后保留 下来的并非都是对个体有利的基因,但是对于整个群体是有利的(宿兵,1996)。 遗传多样性变异越丰富,物种对环境变化的适应能力就越强,越容易扩展其分柿 范围,进化潜力就越大(施立明,1990),从而有助于保护整个物种和整个生态 系统的多样性,减缓由于适应和进化所导致的灭绝过程。因此,对遗传多样性的 研究,可以揭示物种或群体的进化历史(起源的时间、地位和方式),也能为进 一步分析其进化潜力和未来的命运提供重要资料,尤其有助于对物种减少或濒危 的原因以及过程进行分析与讨论(Millar等,1991;陈灵芝,1993)。
另外,研究生物遗传多样性对于合理的利用与保护遗传资源具有十分重要的 意义,这也是保护生物学研究的核心问题之一。只有弄清物种内部遗传变异的大 小,时空分布及其与环境条件的相互关系,才能采取科学有效的措施来保护人类
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赖以生存的遗传资源,才能有效地挽救受到威胁与濒于灭绝的物种。
赖以生存的遗传资源,才能有效地挽救受到威胁与濒于灭绝的物种。 1.1.3畜禽遗传多样性的研究方法
研究遗传多样性一般从染色体多态性、蛋白质多态性和DNA多态性三个方 面进行。染色体多态性
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