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《医学遗传学》第六部分多基因遗传病
多基因遗传、易感性、易患性、阈值、遗传度的概念。 多基因遗传病的遗传度的估算方法。 质量性状与数量性状的特点。 影响多基因遗传病再发风险的因素。 疾病的基因组学 遗传标志(genetic markers) 遗传标记必须满足的二点特性:多态性与位置已知。 SNP: 大于1%,causative SNPs, functional SNPs 遗传标志(genetic markers) 遗传标记必须满足的二点特性:多态性与位置已知。 SNP:大于1% ,causative SNPs, functional SNPs STR:微卫星标记,如(XX)n, (XXX)n, (XXXX)n;其中最常用的为(CA)n。 recombination The formation of new combination of linked genes by crossing over (breakage and rejoining) between their loci. 遗传重组 重组值的计算 连锁( linkage ) 位于同一条染色体上的基因或者遗传标记,它们在减数分裂产生配子的时候,如果倾向于把处在同样染色体上的等位基因共分离到同一个配子中去,这时基因或遗传标记之间的关系称为连锁。 问题:什么是紧密连锁?强连锁?不连锁? Linkage Disequilibrium (LD) The preferential occurrence of a disease gene is associated with specific alleles of linked markers. LD is the non-random association between alleles at two loci. The extent of LD is typically measured by D’. 连锁不平衡 单倍型(haplotype) 单倍型:同一条染色体上紧密相连的两个或两个以上多态 位点的状态的组合。 Phenotype Black eye GATATTCGTACGGA-T Brown eye GATGTTCGTACTGAAT Black eye GATATTCGTACGGA-T Blue eye GATATTCGTACGGAAT Brown eye GATGTTCGTACTGAAT Brown eye GATGTTCGTACTGAAT Haplotypes AG- 2/6 GTA 3/6 AGA 1/6 SNP SNP SNP 重组热点划分成的单倍型块(haplotype block) 在单倍型块中选取标志性位点(tagSNP) 基本概念 allele, allele frequency, genotype, phenotype genetic makers recombination linkage linkage disequilibrium (LD), D’, linkage map haplotype 疾病对象收集 家系收集 如何从疾病入手 疾病家系分析 疾病对象收集 疾病对象包括: 疾病家系 同胞对 散发患者,三口之家 设立对照(隔离群体,随机群体) 家系收集 3~4代以上 有多个患者 疾病确诊(客观标准) 该疾病的外显率要高(外显不全? 延迟显性?) 注意收集其他理化指标 如何从疾病入手 诊断患者异常 a.患者的生化异常 代谢异常, 酶异常蛋白异常 b.患者的形态学特征异常 短指/趾 c.患者的行为学特征异常 唐氏综合征患者智力低下 2. 从临床异常---蛋白异常----基因异常 章
多基因遗传病
数量性状的多基因遗传 Minor gene : 微效基因 Major gene : 主效基因 Additive effect : 累积效应 Polygenic inheritance : 多基因遗传 Multifactorial inheritance : 多因子遗传 Multifactorial traits are those which result from an interaction between multiple genes and often multiple environmental factors.? 复杂性(状)疾病(complex disease): 人类的许多常见病、先天畸形、恶性肿瘤等是由许多对基因控制的。这些基因协
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