第八部分转座.pptVIP

分子生物学 电话E-mail:gwd@zjnu.cn 授课时间：2008-2009学年学期   第一节 概 述 基因组是通过获得新序列，以及原有序列的重组（rearrangement）而演化的。 获得新序列：在细菌中，质粒的接合作用、噬菌体的感染转移遗传信息。在真核生物中，一些病毒在感染周期内转移遗传物质。 重组：相关序列间的不等交换导致基因组的变化。例如SSR多态性。转座也是导致基因组变化的重要原因。 转座子（transposon）：转座子也叫做转座元件、跳跃基因。是在基因组中可移动的DNA序列，不以独立的形式存在（如质粒或噬菌体DNA等），而在基因组内由一个部位直接转移到另一个部位。 一、转座子的概念 转座发生的频率很低，而且插入位点是随机的，不依赖转座子与靶位点之间的任何同源性。 一个转座子由一个部位转移到另一个部位的过程称为转座。 二、转座子的基本特点 一类转座子以编码蛋白质的DNA序列的形式存在，这些蛋白质直接操作DNA，使转座子能够在基因组内繁殖其自身。 另一类转座子与反转录病毒相关，由病毒RNA转录产生转座所需蛋白质。 转座子只负责自身的复制和转移，所以也称为自私DNA（selfish DNA）。 转座子是位于基因组内的独立的实体。 真核细胞中也存在编码自身转座酶的转座子，称为功能性转座子，或自主性转座子。 但真核细胞多数转座子是不含编码活性转座酶基因的，因此丧失了独立转座的能力，称为非功能性转座子，或缺陷性转座子，或非自主性转座子。非功能性转座子可以在同一家族的自主性转座子存在的条件下发生转座。非同一家族则不起作用。 细菌的转座子都携带着编码其自身转座所需的酶的基因，但也可能需要其所在基因组的辅助功能，例如DNA聚合酶、旋转酶等。 三、转座的遗传效应 转座子的插入可以导致基因突变。包括基因的失活、表达产物的改变等。 转座子可直接或间接导致基因组的重排。包括DNA的缺失、倒位。正向重复的转座区之间发生重组将导致缺失，反向重复的转座区之间重组将导致倒位。如图示。 转座产生新的基因。转座子上携带的基因可以引入到基因组中。 转座引起基因组进化。通过转座使相距较远的基因组合到一起，可能会产生新的生物学功能。 第二节 简单转座模块—插入序列 插入序列（IS，Insertion Sequences）：是最简单的转座子，编码转座酶。可以独立发挥转座作用。 插入序列的结构特征： IS元件的末端为短的反向重复序列（inverted terminal repeats），两个末端密切相关，但并不完全一样。 IS元件转座时，插入部位的宿主DNA序列被复制，在转座子两端形成两个短的正向重复序列。 对同一个转座子，在每次转座时，此正向重复序列皆可不同，但其长度是恒定的。一般长度为3-9bp。 多数IS元件可插入到宿主DNA的许多不同部位，但一些IS元件对某些特殊热点显示出一定倾向性。 除IS1之外，所有IS元件都含有一个单一的长编码区，起始于一端的反向重复序列内，终止于另一个反向重复序列之内或之前，编码转座酶。IS1含有两个单独的阅读框，在翻译过程中，要通过移码通读才能产生有功能的转座酶。 一般每个IS元件每代的转座频率为10－3-10－4。单一靶位点插入频率与自发性突变频率相当（10－5-10－7）。 反向重复序列(Inverted repeat) 反向重复序列(Inverted repeat) 第三节 复合转座子 一些转座子两侧是由IS元件组成的臂（含有与转座有关的酶），中心区携带编码转座酶以外的其它基因，这类转座子称为复合转座子。用Tn命名。 复合转座子可以作为一个单位进行转座，但两端的活性IS元件也可独立进行转座。 IS元件组成的臂可以正向或反向方式排列。 两个IS元件可与位于其中间的任何序列一起转座。但是，随着中央区的增长，转座频率降低。所以长度依赖性是决定复合型转座子大小的一个因素。 中心区标志物的选择性提高了复合型转座子的转座频率。 IS元件所编码的转座酶的活性负责识别一个靶部位和识别转座子的末端。只有转座子的末端可作为转座的底物。 第四节 转座的方式 复制型转座：转座的元件被复制，转座的序列是原来元件的一个拷贝。转座需要转座酶，它作用于原转座子的末端。例如TnA转座子。 非复制型转座：转座元件作为一个物理实体直接从一个部位转移到另一个部位。转座发生后供体分子可能被破坏，也可能被宿主修复系统识别并修复。 玉米Ac/Ds转座子家族进行非复制型转座 保守型转座：是非复制转座的一种，转座元件从供体部位被切除，经过一系列过程插入到受体部位。在转座元件切除转移过程中，每个核苷键皆被保留。 转座起始于一个共同的机制，即转座子与靶部位相连接，形成共同中间体。 第五节 转座的机制 首先