单纯性PDA患者TFAP-2B基因单核苷酸多态性研究分析.docVIP

论著 单纯性PDA患儿TFAP-2B基因单核苷酸多态性研究分析 陈轶维 赵武 李奋 吉炜 傅启华 张志芳 王剑 200127 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心心血管内科（陈轶维、李奋、吉炜、张志芳），转化医学研究所（傅启华、王剑）；233004 蚌埠医学院附属第一医院儿科（赵武） 基金项目: 上海高校创新团队发展计划资助（沪教委科2010.29号文）；国家科技部973计划子课题——心脏间隔缺损形成中环境和遗传因素交互作用的研究（编号2010CB529501） 【摘要】 目的 探讨TFAP-2B基因c.1-34GA和c.539+62GC多态性与单纯性动脉导管未闭（patent ductus arteriosus，PDA）发生的相关性，探索PDA发生的可能分子生物学机制。 方法 PDA组为100例经超声心动图诊断明确的单纯性PDA患儿，男性38例，女性62例，平均年龄3.64±2.67岁。对照组为100名健康儿童，男性44例，女性56例，平均年龄4.93±1.14岁，均经超声心动图检查排除先天性心脏畸形。采用聚合酶链式反应（polymerase chain reaction, PCR）扩增TFAP-2B基因的全部外显子和外显子侧翼至少50bp内含子，所有扩增片段均进行双向测序。将所测TFAP-2B基因序列与GeneBank中的已知序列（登录号：NG_008438）通过BLAST程序进行对比以检出可能存在的单核苷酸多态。 结果 在PDA组及对照组中检出TFAP-2B基因2个新的单核苷酸多态（single nucleotide polymorphisms，SNP），根据现有NCBI及GenBank收录资料未见报道，即位于编码区上游第34位鸟嘌呤变为腺嘌呤c.1-34GA和c.539+62GC。其中，c.1-34GA在PDA组等位基因频率及基因型频率均高于对照组（等位基因频率比较：Z =－2.513，P =0.012；基因型频率比较：Z =－2.680，P =0.007）；c.539+62GC等位基因频率及基因型频率在两组中无显著差异（等位基因频率比较：Z =－0.332，P =0.74；基因型频率比较：Z =－0.129，P =0.897）。结论 TFAP-2B基因c.1-34GA多态与单纯性PDA发生有相关性，可能是PDA发生的易感因素之一。 【关键词】：先天性心脏病；动脉导管未闭；TFAP-2B基因； 单核苷酸多态性 Single Nucleotide Polymorphism of TFAP-2B in Children with Patent Ductus Arteriosus CHEN Yi-wei*, ZHAO Wu, LI Fen*, JI Wei*, FU Qi-hua, ZHANG Zhi-fang*, WANG Jian *Department of Cardiology, Shanghai Childrens Medical Center Affiliated to Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai 200127, China Corresponding author：LI Fen (Email: lifen_88@) 【Abstract】Objective To identify the novel variant of TFAP-2B in Chinese patients with congenital patent ductus arteriosus(PDA). Method Clinical data and peripheral blood specimens were collected from a cohort of 100 unrelated subjects with PDA. In all subjects, PDA was confirmed on the basis of evidence of continuous turbulent flow in the pulmonary artery from the precordial and suprasternal notch approaches obtained by using pulsed Doppler echocardiography or cardiac catheterization. The unrelated subjects included 38 boys and 62 girls aged 7 months–11 years, with a median age of 3.64 years. One hundred