个体化医学检测微阵列基因芯片技术规范.PDFVIP

个体化医学检测 微阵列基因芯片技术规范 前言 微阵列基因芯片是基于DNA 分子杂交技术原理研制，通过探针结合碱基互 补序列的单链核酸，从而确定其相应序列来识别基因或其产物。能够同时快速检 测多个基因及其多个位点，在多态性分析、突变分析、基因表达谱测定及杂交测 序等多领域具有广泛应用价值。 临床诊断技术使用的微阵列基因芯片，可快速鉴定病原体、检测遗传突变及 基因表达，更早更方便的检测肿瘤基因标志，检测药物反应和代谢相关基因多态 性来指导临床个体化治疗。 本规范旨在对个体化医学检测中采用微阵列基因芯片检测核酸序列以及基 因表达进行一般性技术指导，不包括行政审批要求。 本规范由全国生物芯片标准化技术委员会（SAC/TC 421 ）提出。 本规范起草单位：全国生物芯片标准化技术委员会、清华大学医学院、生物 芯片北京国家工程研究中心、北京博奥医学检验所。 本规范起草人：项光新、李元源、王辉、邓涛、孙义民、张治位、张川、邢 婉丽、程京。 目录 1.适用范围 1 2.声明/警告 1 3.术语和定义 1 4.样本处理2 4.1 样本类型2 4.2 样本采集、运输与保存3 4.3 样本质量保证3 4.4 样本信息保存3 5.检测各步骤分述4 5.1 核酸分离4 5.2 核酸定量（如适用）4 5.3 核酸扩增和标记4 5.4 芯片杂交5 5.5 信号采集和数据分析5 6.结果报告5 7.质量控制5 8.注意事项6 9.参考文献6 1.适用范围 本规范适用于医疗机构开展微阵列基因芯片个体化医学检测服务。 检测服务需遵循国家卫生主管部门或各专业协会发布的疾病诊疗指南或国 家卫生计生委医政医管局个体化医学检测技术专家委员会发布的个体化医学检 测指南。 2.声明/警告 本规范所称微阵列基因芯片诊断技术是指从医疗机构获得的临床样本中，提 取核酸（DNA 或 RNA ），进行必要的扩增和标记，标记后的靶标与基因芯片进 行分子杂交，通过基因芯片扫描仪器获得基因芯片杂交的图像与数据，经计算机 程序分析，并给出检测报告的全过程。 3.术语和定义 （1）聚合酶链反应 polymerase chain reaction （PCR ） 聚合酶链反应或多聚酶链反应是一种对特定的DNA 或RNA 片段在体外进 行快速扩增的方法。 （2 ）杂交 hybridization 具有一定同源序列的两条核酸单链（DNA 或 RNA ）可以通过氢键的方式， 按碱基互补配对原则相结合。 （3 ）突变 mutation 是细胞中DNA 核苷酸序列发生了稳定的可遗传的改变。 （4 ）点重复 spot replicates 每种探针在芯片上每个阵列中的重复次数。 （5 ）探针 probe 1 能够与靶标特异性结合的分子，多数情况下探针固定在基片上。 （6 ）质控探针quality control probe 用来监控芯片表面化学修饰、样品制备和反应过程等环节的质量的探针。该 探针只与反应体系中外加的带有可检测的标记物的靶标发生特异性结合，故可用 于监控探针和基片的结合质量及探针和靶标结合质量等整个反应过程的质量。 （7 ）表面化学修饰质控探针 surface modification control probe 微阵列基因芯片上用来质控基片的表面化学修饰质量的探针。 （8 ）内标探针 internal control probe 微阵列基因芯片上用来质控检测过程中核酸提取、扩增反应、芯片杂交反应 等过程是否正常的探针。 （9 ）阳性质控探针 positive control probe 设置在微阵列基因芯片上的质控探针，无论被检测样品的结果如何，均能产 生可以被识别的信号。 （10）阴性质控探针 negative control probe