IGS2-RFLP、SCoT和ISSR在白灵侧耳遗传多样性分析中.PDFVIP

菌物学报 jwxt@ 15 July 2013, 32(4): 682-689 Http:// Mycosystema ISSN1672-6472 CN11-5180/Q © 2013 IMCAS, all rights reserved. IGS2-RFLP 、SCoT 和 ISSR 在白灵侧耳遗传多样性分析中 的比较研究 * 赵梦然 陈强 张金霞 邬向丽 黄晨阳 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所 农业部农业微生物资源收集与保藏重点实验室 北京 100081 摘 要：应用IGS2-RFLP、SCoT 和ISSR 标记分析新疆5 个采集地点的28 个白灵侧耳野生样本的遗传多样性，比较 这3 种分子标记在白灵侧耳种质资源遗传多样性研究中的效用。结果显示，IGS2-RFLP 的3 个内切酶、5 个SCoT 引 物、5 个ISSR 引物分别检测到42 、59 和77 条多态性条带，多态性比率分别为91.3%、92.4%和92.8% 。3 种标记检 测出的有效等位基因数（ne ）和位点平均的预期杂合度（Hep ）没有显著性差异。表明3 种标记都适宜作为遗传学标 记对白灵侧耳野生种质进行多样性分析。多态性检测效率最高的标记为ISSR ，E=15.4 ，Ai=23.4 ，其次为IGS2-RFLP， E=14.0 ，Ai=22.4 ，SCoT 则为最低，E=11.8，Ai=18.2 。3 种标记中，SCoT 和ISSR 标记的聚类结果极其相似，且均 能较为准确地反映样本的地理来源，虽然二者的聚类图不完全相同。IGS2-RFLP 的标记效率较高，准确性和可重复 性最好，可用于菌株标准图谱的制作，更适用于品种权保护中的菌株鉴定鉴别；SCoT 和ISSR 标记的多态性高，信 息量大，评价范围广，则更适用于白灵侧耳种质资源的遗传多样性研究。 关键词：野生样本，多态性，有效等位基因，预期杂合度 Comparison studies of genetic diversity of Pleurotus eryngii var. tuoliensis by IGS2-RFLP, SCoT and ISSR markers * ZHAO Meng-Ran CHEN Qiang ZHANG Jin-Xia WU Xiang-Li HUANG Chen-Yang Institute of Agricultural Resources and Regional Planning, Chinese Academy of Agricultural Sciences; Key Laboratory of Microbial Resources, Ministry of Agriculture, Beijing 100081, China Abstract: IGS2-RFLP, SCoT and ISSR markers were applied in the genetic diversity study of 28 wild samples of Pleurotus eryngii var. tuoliensis collected from five locations in Xinjiang Autonomous Region. Effectiveness of the three markers was also compared for genetic diversity evaluation of P. eryngii var. tuoliensis. There were 42, 59 and 77 polymorphic bands from three IGS2-RFLP restriction endonucleases, five SCoT primers and five ISSR primers respectively, with the polymorphism