血清SELDI蛋白质指纹图谱在乳腺癌腋淋巴结转移中的-中国肿瘤临床.pdf

·1010· 2008年第35卷第17期 血清SELDI 蛋白质指纹图谱在乳腺癌 腋淋巴结转移中的应用研究* ① ② ① ① 庞 达 杨艳梅 张国强 马玉彦 唐雅莉 龚建平 华中科技大学同济医学院外科 （武汉市 430030） 摘要 目的：应用SELDI技术和生物信息学方法从血清中筛选乳腺癌蛋白质标志物并构建检测模型，为预测腋 淋巴结（axillarylymphnodes，ALN）转移等提供可能的简便易行的方法。方法：应用SELDI-TOF-MS作为蛋白质组学 研究平台，采用CM10芯片，对乳腺癌的血清进行了检测，探讨了乳腺癌患者血清蛋白质指纹图谱与是否发生ALN转 移的关系，并结合生物信息学方法建立了相应的检测模型。结果：通过对ALN有（无）转移的乳腺癌患者血清蛋白指 纹图谱数据的比较，找到了11个差异蛋白质峰（P0.05），M／Z为M2164.16，M3269.90和M3272.31的3个蛋白质峰 被选择用于构建分类决策树模型，该模型的交叉验证（测试组）总准确率为81.8％，ALN有转移的乳腺癌患者检出率 为83.3％，ALN无转移的检出率为80％。结论：构建的分类决策树模型能达到区分ALN是否有转移的最佳效果， SELDI技术在确定乳腺癌患者是否发生腋淋巴结转移方面有一定的意义。 关键词 乳腺癌 表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱 生物信息学 蛋白质组学 CM10芯片 The Applied Research of Serum Protein Fingerprints in the Prediction of Axillary Lymph Nodes (ALN) Metastasis 1 2 3 2 2 1 PANG Da , YANG Yanmei , ZHANG Guoqiang , MA Yuyan , TANG Yali , GONG Jianping Corresponding author: GONG Jianping, E-mail: jpgong@tjh.tjmu.edu.cn 1Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430030, China 2 Institute of Cancer Prevention and Treatment, Harbin Medical University, Harbin 150040, China 3The Tumor Hospital of Harbin Medical University, Harbin 150040, China Grant Support: Doctoral Fund of Ministry of Education of China (20050226009) Objective: To screen serum tumor biomarkers by SELDI-TOF-MS to establish a subset to be used in the prediction of axillary lymph node metastasis of breast cancer and to establish diagnostic models of breast can- cer. Methods: Serum samples from breast cancer patients with or withou