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多底物酶促反应动力学;国际酶学委员会把酶六大类反应对应于底物的分类如下: ;单底物反应动力学指1,3, 2的正向反应(约40%) 其余多底物反应多为多底物反应(约60%);中心复合物:
指酶活性中心全部被底物占居
命名:(EAB-------------------------EPQ)
E: 稳态酶,
EAB和EPQ:中心过渡态中间物
;1) 有序顺序反应:
xxxxxxx-------- 底物、产物
规定: 反应历程
OOOOOOO------酶存在形式
; ;还有其酶促反应,中心过渡态络合物形成很慢,而分解速度很快。被称为Theorell Chance反应:即形成中间物的速度极慢而分解速度极快。
A B P Q
E EA EQ E ;
;2.随机顺序反应(Randan BiBi):;
;谷丙转氨酶的作用:
谷氨酸 α-酮戊二酸 丙酮酸 丙氨酸
E (E-谷氨酸-F-α-酮戊二酸) F ( F-丙酮酸-F-丙氨酸) E
;底物动力学方法:
有序顺序机制推导法是用图象法推出。
在稳态条件下推出的双底物反应速度公式:
V[A][B]
V=
KmB[A] + KmA[B] + KiaKmB + [A][B]
是底物A与酶E结合的解离常数。
;解释公式中几个常数:
多底物反应中,一底物的米氏常数 可随着另一底物浓度变化而变化。
KmA[B]:指底物[B]浓度达饱和,底物 A的米氏常数。在底物B低于饱 和 浓度时,测得随底物[B]而变化的A 的各个Km,称为表观米氏常数Km
KmB[A]: 指底物[A]浓度达饱和,底物
B的米氏常数。在底物A低于饱和 浓度时,测得随底物[A]而变化的B 的各个Km,称为表观米氏常数Km;1 K mB[A] KmA[B] Kia KmB [A][B]
= + + +
v Vm[A][B] Vm[A][B] Vm[A][B] Vm[A][B]
?
1 K mB KmA Kia KmB 1
= + + +
v Vm[B] Vm[A] Vm[A][B] Vm
1 KmA 1 1
当B=∞, = +
V Vm [A] Vm
?
1 KmB 1 1
当A=∞, = +
V Vm [B] Vm;具体实验方法: 以A、B双底物反应作为例子,可将底物B固定在几个不同浓度下。
固定在某一B浓度时,测不同A浓度对反应速度影响;
也可固定A在某一浓度,测定不同B浓度对反应速度影响,再分别作双倒数图。;Lineweaver-Burk双倒数作图:
当固定几个不同的B浓度或者几个不同的A浓度时,作1/[A] ---1/v 和1/[B ] ---1/v的关系图,得到如下图。;直线的交点在坐标的左侧,这是顺序机制的特点。
且交点可在横坐标的的上方、下方或者线上。
1. 在横坐标上面,表明固定底物B或A与酶结合 不影响 可变底物A或B的Km,即B或A浓度 大小互不影响各自的Km,说明表观 Km app= Km,KmA=Kia, KmB=Kib
2. 在横坐标下方,表明可变底物A的表观 Km 随 B的增加 而增加,KmA<Kia,KmB<Kib
3. 在横坐标上方,表明可变底物A的表观 Km 随 着B的增加
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