伤寒沙门菌基因组DNA芯片基因表达谱分析技术的建立与-江苏大学.PDF

( ) 第 19卷第 4 期 江 苏 大 学 学 报 医 学 版 Vol. 19 No. 4 2009年 7月 　 ( ) 　 Ju l. 2009 Jou rnal of J iangsu U n iversity M edicine Edition 　 　 　 　 　 　 伤寒沙门菌基因组 DNA 芯片基因表达谱 分析技术的建立与优化 生秀梅 , 黄新祥 , 徐顺高 , 张海方 , 许化溪 (江苏大学基础医学与医学技术学院 , 江苏 镇江 2 120 13) [摘 　要 ] 　目的: 建立和优化基于伤寒沙门菌全基因组 DNA 芯片的基因表达谱分析技术 。方法 : 提取伤寒沙门菌 ( ) ( ) ( ) 野生 z66 阳性菌株总 RNA , 以 6, 9核苷酸随机引物 N 6、N 9 和 或 基因组特异引物 GD P 反转录合成 cDNA ,用荧光 素 Cy5或 Cy3直接掺入标记后 ,与包括伤寒沙门菌 420 1个蛋白编码基因的伤寒沙门菌全基因组芯片杂交 ,用芯片扫 描仪扫描后获得表达谱分析结果 ,经过数据标准化处理后进行分析 。结果 : 采用 N 9 + GD P 混合引物 ,直接掺入法标 记时 ,既能获得较好标记效果 ,又能节约试剂成本 , 同时可减少繁琐步骤所引起的不必要失误 。结论 : 建立的基于伤 寒沙门菌基因组 DNA 芯片的基因表达谱分析技术 ,为细菌的基因表达调控及功能基因组学研究提供了平台。 [关键词 ] 　伤寒沙门菌 ; 基因组 ; DNA 芯片 ; 基因表达谱 [中图分类号 ] 　R378. 23; Q786　　[文献标志码 ] 　A 　　[文章编号 ] 　167 1 - 7783 (2009) 04 - 0281 - 05 D evelopm en t and optim iza tion of D NA m icroarrayba sed S a lm on e lla en ter ica serovar Typh i gene expression prof iling SHEN G X iu m ei, HUAN G X in x iang, X U S hun g ao, ZHAN G H a if ang, X U H ua x i ( School of M edical Science and L aboratory M edicine, J iangsu U n iversity, Zhenj iang J iangsu 2 120 13 , Ch ina) [ A b stract] 　O bjective : To develop and op tim ize the S a lm onella en terica serovar Typ h i genom ic DNA m i croarrayba sed gene exp re ssion p rofiling. M ethods: Total RNA of the z66po sitive w