原创力文档- 1、本文档共7页，可阅读全部内容。
- 2、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
查看更多
林业科学研究 2015 ，28 (1):37 43
Forest Ｒesearch
文章编号:1001-1498 (2015)01-0037-07
利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的
SSＲ 和SNP 特征
1 ，2 1 ，3* 1 1 ，2 1 ，2 1
雷淑芸 ，张发起 ，Khan Gulzar ，王久利 ，刘海瑞 ，陈世龙
(1． ， ， 810008 ;2． ，
中国科学院高原生物适应与进化重点实验室 中国科学院西北高原生物研究所 青海西宁 中国科学院大学
100049 ;3． ， 400715 )
北京 西南大学生命科学学院 重庆
摘 : Illumina HiSeqTM 2000 平台对采自青海玉树的青杨进行高通量 ，SSＲ 7 067 SSＲ ，
要 利用 测序 分析共获得 条 序列
SSＲ 525 ， 0． 149 ， 4 531． 87 bp 。SSＲ ，
复合型 共 条 发生频率 平均跨度 重复类型中 单核苷酸重复类型最多
(33. 96% ); (31． 00% ); (27． 69% ); 、 、
三核苷酸重复类型次之 二核苷酸重复类型位居第三 四核苷酸 五核苷酸 六核
苷酸重复类型SSＲ 含量很少(＜ 8% )。二核苷酸重复类型中，AG 重复类型所占比例最高，GA 次之，CT、TC 则紧随
; ，AAG ，GAA ，TTC 、AGA 、GAG、CAG、TCT 、TGG
其后 三核苷酸重复类型中 重复类型所占比例最高 次之 等重复类型
。SNP ，L1A SNP 162 343 ，L2A SNP 229 115 。SNP ，
数量相近 分析发现 中含 个 中含 个 类型中 转换类型明显高于颠
，L1A 61． 06% ， 38． 94% ，L2A 61． 27% ， 38． 73% 。
换类型 中转换类型占 颠换类型占 中转换类型占 颠换类型占 转换
，C-T ， 30． 75% 、30． 66% ，A-G C-T ， 30． 31% 、30． 62% 。
类型中
文档评论（0）