蛋白质多序列比对注释软件ESPript 3.0.ppt

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蛋白质多序列比对注释软件 ESPript 3.0 http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/ http://espript.ibcp.fr/ESPript/ESPript/index.php ESPript,?‘Easy Sequencing in PostScript’, 是一个根据比对的序列呈现其相似性以及二级结构信息的程序。 提交运行 退出 初级 高级 专业级 效果图 导入比对文件 设置参数 Submit 导入PDB文件,设置参数 PDB文件必须与放第一位的序列对应 不对应的情况下,可以调节Defining groups PDB文件包含实验验证过的蛋白,核酸以及复合体的三维结构。 /pdb/home/home.do all代表按原次序排列 3 1 2 4代表将3序列提前 输出设置 图片类型和分辨率 相似的算法设置,一般不调动 Example 1: 计算第三行序列的疏水性: P R 3 (hyd将被写成红色) Example 2:将第250,260-263位加上红色星号(S R 250 260-263) Example 3: 将第二行的标题改成绿色: T G 2 设置文字大小、一排字数、颜色、纸张类型; 行间距及其他排列 简单演示 http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/ /pdb/home/home.do http://espript.ibcp.fr/ESPript/ESPript/index.php

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