不同倍性鱼及其父母本中短散在重复序列的遗传变异与多样性研究.pdf

分类号 密级 学校代码 10542 学号200921411016 不同倍性鱼及其父母本中短散在重复序列 的遗传变异与多样性研究 Variationand of polymorphismanalysis in SINEsdifferent and ploidy--levelhybrids their parents 研 究 生 姓 名 李帑洛 指导教师姓名、职称 刘少军教授 学 科 发育生物学 研 究 水生经济动物繁殖与育种 湖南师范大学学位评定委员会办公室 二零一二年六月 1IIII I ll I lUl II IIIIIII Y2148046 摘 要 在真核生物基因组中存在着丰富的可移动元件(Transposable Elements，TEs)，它们是基因组中最具活力的组成成分之一，主要 分为DNA转座子和反转座子。其中的短散在重复序列(Short interspersed 部分能够无害的插入到基因组的非功能区域。并且，一旦它们插入 到基因组中，就很难再被完全删除。因此，SINEs是一种行之有效 的分子遗传标记。不少研究者都致力于通过在不同的物种中发现新 的反转座子家族来研究和分析反转座子的遗传和进化，并将之应用 于系统发育分析。Hamo SINE家族是一类广泛存在于自然鲤科鱼类 中的反转座子家族，并且已有研究对该科鱼类中的HamoSINE家族 进行了遗传进化分析。 虽然在自然界鱼类中已经有大量有关反转座子的研究，但在多 倍体鱼中却鲜有报道，特别是关于远缘杂交和多倍化对多倍体杂交 鱼后代中反转座子产生的影响的研究还未见报道。 在以往的研究中，通过远缘杂交技术将红鲫(Ca，馏Jsi“s口“r臼f扰s red var，RCC9，2n2100，)与团头鲂(Megalobrama amblycephala， BSB8，2n=48)进行亚科间杂交获得了两性可育的四倍体鲫鲂杂交鱼 (4nRB)和不育的三倍体鲫鲂杂交鱼(3nRB)。在此基础上，本论 文主要研究了杂交和多倍化对这两种多倍体杂交鱼中反转座子家族 产生的不同影响，并对两种不同倍性多倍体杂交鱼及其亲本的SINEs 新家族进行了挖掘，主要研究内容如下： 一、以广泛存在于鲤科鱼类中的HAmoSINE反转座子家族为基 础，通过大规模克隆测序和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术(PAGE) 分析了该家族在红鲫、团头鲂、四倍体鲫鲂以及三倍体鲫鲂杂交鱼 后代中的遗传变异和多态性情况。在团头鲂中扩增出了两种长度的 片段，这些片段只相差一个碱基且相似度非常的高；在红鲫中，扩 增出了4种长度的片段，这些片段问的差异性较团头鲂要高；在四 倍体鲫鲂杂交鱼后代中，HAmoSINE家族产生了明显高于亲本的变 异，这些变异包括长度的变化，碱基的突变与增减以及小片段的插 入，从而导致其多态性显著增加；在三倍体鲫鲂杂交鱼后代中，该 家族则表现出较高的保守性。这些结果一方面反映了远缘杂交和多 倍化对杂交鱼后代基因组