金华猪和长白猪粪便微生物移植小鼠的肠道古菌结构分析.PDF

动物营养学报２０１７，２９（６）：１８９５⁃１９０３ ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌ ｏｆ ＡｎｉｍａｌＮｕｔｒｉｔｉｏｎ 　 ｄｏｉ：１０．３９６９／ ｊ．ｉｓｓｎ．１００６⁃２６７ｘ．２０１７．０６．０１０ 金华猪和长白猪粪便微生物移植小鼠的 肠道古菌结构分析 １ ２，３ ２，３ １ １ １ １∗ 肖英平 　 王军军 　 李天天 　 唐　 标 　 何祥祥 　 李开锋 　 杨　 华 （１．浙江农业科学院农产品质量标准研究所，杭州 ３１００２１；２．北京食品营养与人类健康高精尖创新中心， 北京 １００１９３；３． 中国农业大学动物科技学院，北京 １００１９３） 摘　 要： 本试验旨在比较肥胖型的金华猪和瘦肉型的长白猪肠道古菌结构的差异，分析菌群移 植小鼠肠道古菌结构。 采集金华猪和长白猪的新鲜粪便，通过灌胃移植到经广谱抗生素处理过 的小鼠肠道中，提取２种猪粪便及其移植小鼠的盲肠内容物总基因组ＤＮＡ，使用古菌通用引物 对古菌１６ＳｒＲＮＡ 的Ｖ４ 区进行ＰＣＲ扩增，通过Ｉｌｌｕｍｉｎａ Ｈｉｓｅｑ 测序平台对扩增产物进行高通量 测序，使用ＱＩＩＭＥ 等软件对测序序列进行分析统计。 结果表明：金华猪和长白猪粪便及其移植 小鼠盲肠内容物中的古菌主要包含３ 个门，分别为奇古菌门（Ｔｈａｕｍａｒｃｈａｅｏｔａ）、广古菌门（Ｅｕｒ⁃ ｙａｒｃｈａｅｏｔａ）和泉古菌门（Ｃｒｅｎａｒｃｈａｅｏｔａ），其中金华猪粪便中广古菌门的丰度高于长白猪；在属水 平上主要包含４ 个已知属，优势属为餐古菌属（Ｃｅｎａｒｃｈａｅｕｍ）。 二者移植小鼠的盲肠内容物古 菌结构，在门水平上，移植小鼠的奇古菌门比例占７０％以上；奇古菌门的古菌几乎全部来源于餐 古菌属；在门和属的水平上，金华猪和长白猪粪便移植小鼠的盲肠古菌结构无显著差异（Ｐ＞ ０．０５），但基于操作分类单元（ＯＴＵ）水平的主成分分析显示出很好的组内聚集。 由此可见，奇古 菌门的餐古菌属是金华猪和长白猪粪便和其移植小鼠盲肠中的优势古菌；金华猪粪便中广古菌 门的丰度高于长白猪粪便，且二者移植小鼠盲肠内容物之间古菌结构在 ＯＴＵ 水平上存在一定 的差异。 关键词： 古菌；金华猪；长白猪；粪菌移植；高通量测序 中图分类号：Ｓ８２８　 　 　 　 文献标识码：Ａ　 　 　 　 文章编号：１００６⁃２６７Ｘ（２０１７）０６⁃１８９５⁃０９ 　 　 猪肉历来是我国居民肉类消费品的主要来 　 　 肠道微生物区系是哺乳动物体内最复杂和最 源，在国计民生中占有重要地位。 金华猪是我国 大的微生态系统，对宿主的健康、进化及行为产生 － ［３ ４］ 著名的地方品种，有“中国熊猫猪”的美誉，其头部 明显的影响 。 古菌（Ａｒｃｈａｅａ）是肠道微生物的 和尾部为黑色，故又名两头乌。 具有皮薄骨细、肉 重要组成部分之一。 古菌最初发现于高热、高盐 质鲜美、性成熟早、繁殖能力强、杂交优势显著的 度、缺氧的极端环境中（如火山口、盐湖），后通过 ［１］ 特点，但其生长速度慢、瘦肉率低 。 而长白猪 １６ＳｒＲＮＡ 的比较，发现其明显不同于细菌（Ｂａｃｔｅ⁃ （Ｌａｎｄｒａｃｅ ｐｉｇ）是优良的外来品种，原产于丹麦， ｒｉａ）和真核生物（Ｅｕｋａｒｙａ），与后两者并列称为三 － ［５