对未知核酸序列的生物信息学分析.docVIP

PAGE I 学 号 《生物信息学》结课论文 对一段未知核酸序列C5的生物信息学分析 院（系）名 称： 理学院 专 业 名 称： 生物制药 学 生 姓 名： 于 茜 指 导 教 师： 徐丹丹 哈尔滨学院 2014年7月 题目内容：现有一段编码未知蛋白的cDNA序列，请利用生物信息学数据库和相关软件进行处理分析，获得关于这段基因的结构和功能信息，并预测其编码蛋白质的性质和功能。分析内容包括其可能表达蛋白质的理化性质，所属蛋白质家族类型，蛋白质二级结构，亲疏水性及结构域的初步分析等。 论文报告要求： 一、要求学生独立写作完成，严禁采取抄袭资料文献或他人代写等手段编造论文，如有类似情况发生，一经发现，当事学生不能结业此科课程。 二、正文字数一般在2000字以上字。 三、论文(设计)主要由以下4部分组成，即： 1. 论文题目 根据所给命题方向进行分析，具体分析对象可以从老师所提供序列选取或自选。 2. 内容摘要 要求用简练的语言概述研究的主要内容，主要包括研究方法、结论及意义等。字数一般在150字左右，并在摘要后列出3-5个关键词。 3. 论文正文 论文(设计)的主体和核心部分，要求学生运用已经学过的专业知识对命题进行分析并形成报告。报告正文分为，“分析流程”，“结果与分析”，“结论”三部分。其中“分析流程”的分析步骤，使用软件及数据库网址逐一列出，或流程图形式呈现。“结果分析”要有数据图文结果和并做分析描述，层次清楚。“结论”部分对分析结果的综合总结性描述。论文报告要结构合理，段落层次清晰，逻辑严谨，图文结合。 4. 参考资料 对所引用的他人观点、参考资料等须按论文中引用的顺序列出，格式要规范（按作者、论文题目〈或著作〉、杂志或出版社名称、刊登或出版日期等）。 四、论文(设计)统一用A4纸张打印，“论文题目”、“内容摘要”的标题用小三号黑体字打印。内容摘要、论文正文一般用小四号、宋体、18磅行距打印。 《生物信息学》结课论文 对一段未知核酸序列C5的生物信息学分析 PAGE PAGE 4 PAGE PAGE 3 摘 要 大量的蛋白质和核酸数据的积累与理性地分析这些数据中所蕴涵的生物学意义的双重需要，产生了综合生物学研究与计算机技术研究等领域最新成果的交叉性学科-生物信息学。也就是说,生物信息学是把核酸、蛋白质等生物大分子的数据库作为主要的研究对象,并结合数学、统计、计算机科学等研究手段来对大量生物学原始试验数据进行存储、整理、管理、注释、加工,使之成为具有明确生物学意义的生物信息。本论文研究的主要内容是运用生物信息学的手段，利用生物信息学数据库和相关软件对一段编码未知蛋白的cDNA序列进行生物信息学分析，然后利用所获得的信息证实其生物学功能。 关键词：生物信息学；C5序列；序列分析；蛋白质性质分析；蛋白质结构预测 第一章 实验材料 由老师提供的一段未知核酸序列C5，该序列为： GGGGAACAGCGCCGAGATCGGCAAGCAAGGGCGAATTTTCCAATACTTTTTAGTTTTTTCCACAGTTTCTCTTCCAAATTTCTTTAATCTGTAACCATGTCTCAGACTACTGTCCTTAAGGTTGCTATGTCATGTCAAGGCTGTGTTGGGGCCGTCAAAAGGGTCTTGGGAAAACTGGAAGGAGTTGAGACGTATGACATCGACATTGATGCACAAAAGGTGACTGTGAAAGGAAATGTAGAGCGCGATGTAGTTTTCCAAACTGTTTCAAAAACTGGCAAGAAGACTGCCTACTGGGAAGAGGATGCCTCGGCAGCACCTGCAGCGACACCAGCACCGGCTGAAGCAGAAGCTAAACCTGCCGAGCCCCTGGCCGCTATTTAAACTATTCACCATTTACATAATGGAAATTTTCTGTTCAATGCATAAGGTCTTTATTTCCTGAAGCTAATAATATTGTAATTGTATGCAAAACTTGTCTATTTAGTCTATGTAATACTTTTATTTGAGCGTCTCTTGTATGACCGTCTACGTTAAATCTTAACCATAGTCTACAGATATATATATATATCT 实验方法 操作流程如下： 核酸序列 核酸序列 ORF ORF 蛋白质序列 蛋白质序列 蛋白质高级结构预测 蛋白质高级结构预测 序列分析 序列分析 三级结构预测结构功能域二级结构预测ORF预测启动子反向互补序列反向序列互补序列 三级结构预测 结构功能域 二级结构预测 ORF预测 启动子 反向互补序列 反向序列 互补序列 理化性质 理化性质 蛋白质 性质