蛋白质的序列分析及结构预测分析.pptVIP

蛋白质的序列分析及结构预测分析;蛋白序列分析 蛋白结构预测;蛋白质的序列分析;分子量 酶切特性 等电点 分子式 原子总数 负电荷残基数 正电荷残基数 稳定系数 脂肪系数 总平均疏水性等;以已知蛋白质序列为例Lyz [Enterobacteria phage P1];相关软件程序;以ExPASy软件为例基本理化性质分析;氨基酸数量185;氨基酸组成;分子式和总原子数;疏水性分析;疏水性分析图;酶切特性预测;;;蛋白质结构预测分析;不同的氨基酸残基对于形成不同的二级结构元件具有不同的倾向性。 目前一级结构和二级结构的分析已经得到了充分研究 三级结构的预测较为困难：最理想的方法是对蛋白质结构数据或相关资源进行同源性检测 近年来出现了一些新的方法可以直接从一级结构到三级结构 ;介绍几个二级结构概念;利用HNN软件进行二级结构预测???法;上述分析结果;各二级结构所占比例;结果表明，该蛋白质只由着3中二级结构组成，即α-螺旋(Alpha helix)，占41.62%；随机卷曲(random coil)，占 50.81%；延伸链(extended strand)，占7.57%。;其他特殊局部结构的分析;信号肽分析;;C-score (raw cleavage site score)：原始剪切位点得分 S-score (signal peptide score)：信号肽分数 Y-score (combined cleavage site score)：被结合得剪切位点的分数;;有信号肽的蛋白序列分析;跨膜区预测--两种不同软件预测结构对比;跨膜区分析;其他软件分析的跨膜区分析;卷曲螺旋(Coiled Coils);;三级结构的预测;点击 SWISS-MODEL - An automated knowledge-based protein modelling server ;页面左边工作栏;三级结构图片;