X射线晶体衍射测定蛋白质三维结构.PPT

晶体什么样（4） 2.晶体和点阵结构 晶体的周期性结构使得我们可以把它抽象成“点阵”来研究. 一维周期性结构与直线点阵 二维周期性结构与平面点阵 三维周期性结构与空间点阵 一维周期性结构与直线点阵 二维周期性结构与平面点阵 三维周期性结构与空间点阵 晶胞(Unit cell) 空间点阵的单位（大小和形状完全相同的平行六面体），是晶体结构的最小单位。 同一个空间点阵，划分平行六面体的方式是多种多样的。 选择平行六面体的原则： ①所选平行六面体的对称性应符合整个空间点阵的对称性。 ② 选择棱与棱之间直角关系为最多的平行六面体 ③ 所选平行六面体之体积应最小。 ④ 当对称性规定棱间的交角不能为直角关系时，应选择结点间距小的行列作为平行六面体的棱，且棱间的交角接近于直角的平行六面体。 单位平行六面体，a、b、c 、?、?、? 是表征它本身形状、大小的一组参数，称为格子参数或点阵参数。 c a b ? ? ? 单位平行六面体参数 单位平行六面体与坐标轴的关系：棱交角＝坐标轴之间交角。 a、b、c ＝轴单位。 a、b、c、?、?、? 关系有七种情况，与单位平行六面体七种格子相对应。 立方格子 a=b=c ?=?=? =90o 三方格子 a=b=c ?=?=? ≠90o， 60， 109o2816 菱面体格子中α为特殊角度时，演变成的三种立方体格子 四方格子 a=b ≠ c ?=?=? =90o 六方格子 a=b≠c ?=?=90o ? =120o 正交格子 a ≠ b ≠ c ?=?=? =90o 单斜格子 a ≠ b ≠ c ?=? =90o ? ≠90o 三斜格子 a ≠b ≠c ?≠ ?≠ ? ≠ 90o 按结点位置，可有四种不同的类型： P—— 原始格子（角顶） C—— 底心格子（角顶、顶底面） I —— 体心格子（角顶、体心） F—— 面心格子（角顶、每个面） P—— 原始格子（角顶） C—— 底心格子（角顶、顶底面） I —— 体心格子（角顶、体心） F—— 面心格子（角顶、每个面） 结构中代表各类等同点的结点在空间的排列方式来说，格子的种类有、且只有十四种。 衍射方向 二、X射线晶体结构测定基本过程 ①蛋白质获取（提纯） ②晶体生长并经冷冻技术处理 ③重原子衍生物制备 ④衍射数据收集 ⑤衍生数据分析和改进 ⑥结构模型的获取（包括修正） （2）晶体生长过程及影响因素 晶核（尽量少） 微晶（可用作晶种） 晶体在数小时至数月后出现 2个问题： 是盐晶吗？ 能给出有用的衍射吗？（多晶/双晶） * * 蛋白质结构测定 2011-3-30 蛋白质三维结构测定方法及数量 蛋白质三维结构测定年增长图 第一节：X-射线衍射技术用于蛋白质晶体结构测定 原理 基本过程 优缺点 应用实例 一、相关原理 光的衍射现象 X射线的发现及应用 本质的争论 X射线衍射的发现 晶体学基础知识 X射线晶体衍射 ? ‘光线’拐弯了！ 1.光的衍射现象 衍射现象：光波偏离直线传播而出现光强不均匀 分布的现象 当缝的大小（或障碍物的大小）跟波长相差不多时就发生明显的衍射现象．如果缝很宽，其宽度远大于波长，则波通过缝后基本上是沿直线传播的，衍射现象就很不明显了． 惠更斯—菲涅耳原理 菲涅耳补充：从同一波阵面上各点发出的子波是相干波。 ——1818年 惠更斯：光波阵面上每一点都可以看作新的子波源，以后任意时刻，这些子波的包迹就是该时刻的波阵面。 ——1690年 解释不了光强分布！ 2. X射线的发现历程及应用 失之交臂 1836 法拉第 发现阴极射线 1861 克鲁克斯 阴极射线管在放电时会产生亮光 干版和光片有问题？ 1890 古德斯柏德 洗出了一张X射线的透视底片 照片的冲洗药水或冲洗技术 发现X射线 本质的争论 X射线衍射 2.X射线的发现及应用 1895年 伦琴（Roentgen）发现故称为伦琴射线。 伦琴夫人的手的X射线照片 X射线在医学上的应用 伦琴的新发现轰动了全世界, 不到