第11章微生物的分类和鉴定 (2).pptVIP

微生物学 第十章 微生物的分类和鉴定 第一节 通用分类单元 第二节 微生物的命名 第三节 各大类微生物的分类系统纲要 第四节 微生物的分类和鉴定 微生物分类学是已们按微生物的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群的科学。 （一）微生物分类学的任务是： 分类、鉴定和命名 （二）微生物的分类鉴定方法 微生物的分类鉴定是微生物学中的基础性工作。不论对象属于哪一类，其工作步骤离不开以下三步： 获得该微生物的纯种培养物（pure culture)； 测定一系列必要的鉴定指标； 查找权威性鉴定手册。 经典的分类鉴定方法 现代的分类鉴定方法 经典分类鉴定方法： 微生物分类是在对大量单个微生物进行观察、分析和描述的基础上，以它们的形态、结构、生理生化反应和遗传性等特征的异同为依据，并根据生物进化的规律和应用方便，将微生物分门别类地排列成一个系统。因此，对分类依据的研究和探讨极其重要。传统的分类方法的分类依据主要有以下几个方面：形态、生理、生化、生态、生活史、血清学、 对噬菌体敏感性等。 1） 形态特征 菌体形态特征包括个体特征和群体特征。 个体特征包括在显微镜下的细胞大小、形状、排列方式、能否运动、鞭毛着生部位和数目、有无芽孢及其着生部位和形状、有无荚膜，放线菌和真菌繁殖器官的形状、构造、孢子数目、形状、大小、颜色和表面特征等。 2) 生理和生化特征 a)????营养来源 b)? 代谢产物 c)?? 与温度和氧气的关系 3)血清学反应 有时确定微生物的种，尤其是亚种，仅依据形态、生理生化等特征很难区分开，因此，常需借助血清学反应。就是将已知菌种、型或菌株制成抗血清，根据它是否与待鉴定对象发生特异性血清反应鉴别未知菌。此反应也用于病毒分类，尤其是噬菌体分类。 4）生态特性 微生物与其它生物的寄生或共生等关系往往有一定专一性，常常也作为分类的依据。如根瘤菌属的分类主要以其共生对象作依据。细菌的致病性在分类上也有一定的重要性。另外，微生物在自然界的分布，是否耐高渗、是否嗜盐性等，有时也作为分类的参考依据。 5） 生活史（life cycle） 上代个体经一系列生长、发育阶段而产生下一代个体的全部经历，就称为该生物的生活史或生命周期。微生物个体发育的阶段变化也是分类鉴别的重要依据。 6） 对噬菌体的敏感性 与血清反应类似，各噬菌体有严格的寄生范围，所以根据菌体对噬菌体的敏感性，可以区分不同类型的微生物。 2、Enterotube 系统 3、Biolog全自动或手动细菌鉴定系统 在96孔的细菌培养板上检测微生物对不同发酵性碳源利用情况进行的分类鉴定。 2 现代微生物分类方法 随着分子生物学的发展，许多新技术、新方法用于微生物的分类，这些方法不再局限于外部形态、生理生化反应，而是深入研究细胞内部，如核酸、蛋白质、脂肪和糖类。触及生物的化学本质问题。但是其手续繁杂，代价高昂，在发现规律性方面还有待于进一步研究。目前还不能在微生物分类中普遍应用。现代分类法的分类依据主要有以下几方面。 1）通过核酸分析鉴定的微生物遗传型： （1）DNA碱基比例的测定： DNA是遗传物质的携带者，它决定生物的表型。遗传信息在DNA中的存在形式表现为DNA的碱基数目及其排列顺序。亲缘关系越远的种，其碱基数目和排列顺序相差越大。所以确定了碱基的数目和序列即可确定“种”。 同种生物的DNA碱基对的顺序和数量，在细胞中比例是稳定的，不受年龄和外界影响，所以通过测定DNA的碱基比例（G+C的百分比值），可以判断微生物种属间的亲缘关系的远近。各类微生物的G+C比值变化幅度为27~75克分子%。任何两种微生物的G+C含量相差10%以上，这两种微生物就肯定不属于同一个种。 一些微生物的G+C含量 菌种 G-C含量（mol%） 细菌 大肠杆菌 50~52 伤寒沙门氏杆菌 50~53 短乳杆菌 45.5 铜绿假单胞菌 64~67 放线菌 灰色链霉菌 69.5~73 丙酸放线菌 66.5 星状诺卡氏菌