二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象,称为模体(motif)。 模体是具有特殊功能的超二级结构。 Βαβ ββ 亮氨酸拉链 生物化学与分子生物学(第9版) 钙结合蛋白中结合钙离子的模体 锌指结构 α-螺旋-β转角(或环)-α-螺旋模体 链-β转角-链模体 链-β转角-α-螺旋-β转角-链模体 模体常见的形式 生物化学与分子生物学(第9版) (二)结构域是三级结构层次上的独立功能区 分子量较大的蛋白质常可折叠成多个结构较为紧密且稳定的区域,并各行其功能,称为结构域(domain)。 大多数结构域含有序列上连续的100至200个氨基酸残基,若用限制性蛋白酶水解,含多个结构域的蛋白质常分解出独立的结构域,而各结构域的构象可以基本不改变,并保持其功能。 超二级结构则不具备这种特点。 因此,结构域也可看作是球状蛋白质的独立折叠单位,有较为独立的三维空间结构。 生物化学与分子生物学(第9版) 3-磷酸甘油醛脱氢酶亚基的结构示意图 生物化学与分子生物学(第9版) 疏水键、离子键、氢键和范德华力等。 主要的化学键: 整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。 定义: (三)三级结构是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置 生物化学与分子生物学(第9版) 肌
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