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比较基因组与分子进化;分子进化
除RNA病毒外,几乎所有生命的蓝图都用DNA书写,进化的第一原因是基因突变。;Human
fishβ-globin; 分子进化的速率约为10-9 ,每年每个氨基酸座位的1×10-9进化速率为分子进化速率的单位,即1×10-9为1鲍林。;1.分子进化速率具有恒定性
对于各种生物物种的每一个蛋白质,用每一个位点每年发生的氨基酸替换的次数为标准衡量分子进化的速率是大致恒定的,只要该分子的功能和三维结构保持不变;
;2.分子进化的保守性不同
对生物生存制约性大的生物大分子进化速度慢。生物大分子内部功能区结构变化的速度较慢, 而且功能越重要的区域变化速度越慢。
; 1. 大多数无害突变基因在选择上是中性的, 并不 影响个体的适合度。
; 2. 中性基因在群体中的固定主要是由随机 遗传漂变引起的。
;3. 新基因主要是通过基因重复后再突变 而产生的 ;四、PCR技术在古分子系统学中的应用;Homo sapiens;确定生物大分子和物种
由古生物学确定各物种分岐时间
比较各物种之间该种生物大分子间的差异;比较基因组学;1985发起
1988. 美国能源部与国家医学研究院
30亿美元
1990. 正式启动.
1998. Celera 公司宣布一项提前完成基因组测序的3年计划
2001年2月同时在 Nature 和 Science 发表;1、大肠杆菌 (Escherichia coli)
2、酵母 (Saccharomyces cerevisiae)
3、拟南芥(Arabidopsis thaliana)
4、线虫 (Caenorhabditis elegans)
5、果蝇 (Drosophila melanogaster)
6、小鼠 (Mus musculus);(Escherichia coli);a.70个与人类同源的酵母基因参与修复基因突变
b.许多与肿瘤相关基因由研究酵母而发现
c.酵母基因组的优点: 基因数目少 (6000) 内含子少 31% 的酵母基因表达产物与人类同源;a.有959个细胞
b.有131细胞凋亡
c.细胞凋亡与人类几种神经系统疾病相关
Alzheimers 阿尔海默症
Huntington 亨廷顿舞蹈症
Parkinsons 帕金森震颤症;a.许多已知影响功能的基因突变来自果蝇的研究
b.60% 的基因与人类同源
c.289 种人类疾病基因突变中有61%在果蝇中发现
d.有68% 的肿瘤相关基因在果蝇中存在;a. “微型人”
b. 生理系统与人非常相似
c. 90%的基因与人类同源; ; 6.拟南芥;拟???芥;人类基因组大小为30亿碱基对,哺乳动物基因组大小与人相近。
人类有超过98%的基因与灵长类同源, 两者的基因之间约 有95-98% 相似。
果蝇甚至有 60% 的基因与人类同源。
人类与小鼠基因组序列有40%的一致,有24%的人类基因组序列在小鼠中没有;1.能深入理解脊椎动物的进化;
2.明确不同的物种在基因组水平的异同;
3.可以从研究其它生物的同源基因揭示人类基因的功能;
4.有助于鉴别编码序列、调控序列及非编码序列。; 比较基因组学促进转化医学研究
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