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Chapter 3 Transcription Content: 一、Some basic conception 二、Transcription in the Prokaryotic Nucleus 三、Transcription in the Eukaryotic Nucleus 四、mRNA Differences between Prokaryotes and eukaryotes 五、Production of mature mRNA in Eukaryotes 一、Some basic conception 6.转录的不对称性: 在RNA的合成中,DNA的二条链中仅有一条链可作为转录的模板,称为转录的不对称性 真核生物中的RNA 聚合酶 RNA 聚合酶Ⅰ:rRNA; 45S? RNA 聚合酶Ⅱ:hnRNA; RNA 聚合酶Ⅲ: tRNA; 5sRNA; snRNA 8-16个亚基组成 同种生物有共享小亚基的倾向; 聚合酶中有两个相对分子质量超过105的大亚基 Recognition sequences in the promoter -10 consensus sequence: TATAAT -35 consensus sequence: TTGACA How does RNA polymerase find the promoter? RNA polymerase scans DNA linearly Slides along DNA without opening strands Detects sequences of -10 and -35 in the major groove Sigma factor allows RNA polymerase to bind to promoter The first events at the promoter RNA polymerase binds to the -35 region This is called a closed complex because the DNA is still base-paired (一)Rho independent Hairpins and poly(U) stretch Hairpins are formed by transcription of palindromes Stop signals exist at the end of the transcript The terminated message (二)Rho dependent Rho factor has an ATP-dependent RNA-DNA helicase activity Still have a hairpin but no poly(U) stretch In both cases, the signal to terminate transcription is present in the newly transcribed RNA, not in the DNA Rho dependent termination (三)抗终止及抗终止因子 1.destroy RNA neck-loop structure 2. The resist termination depending on protein element 抗终止的机制: 1. 破坏终止位点RNA的茎环结构 2.依赖于蛋白质因子的抗终止 λ噬菌体N基因编码N蛋白具有抗转录终止作用,其功能的发挥依靠宿主编码的NusA、NusB、S10等蛋白,这些因子结合到DNA终止位点附近的DNA位点是实现抗终止的必要条件,该DNA位点含有A区(CGCTTTA)和一个二重对称序列,N蛋白能够识别二重对称序列转录形成的茎环结构并与之结合,NusA的一个亚基与RNA聚合酶结合,另一个亚基与N蛋白结合,当其他三种蛋白都结合到Nut位点时,便形成复合蛋白,通过NusA和RNA聚合酶的结合改变聚合酶的构象,使之对终止信号不敏感,继续催化RNA链的合成 真核生物RNA聚合酶一般有8-14个亚基组成,相对分子质量超过5×105 遵循两条原则: 1.聚合酶中有两个相对分子质量超过1×105的大亚基。 2.同种生物3类聚合酶有共享小亚基的倾向。 除了细胞核内存在RNA聚合酶外,线粒体和叶绿体内也存在不同的RNA聚合酶,与噬菌体或细菌的有同源性。 启动子区的识别 RNA聚合酶不直接识别碱基对本身,而是通过氢键互补的方式加以识别。 1、核心启动子 ●定义:指保证R
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