分子标记与其在植物遗传育种中应用.ppt

应用比较基因组学进行基因的克隆 绿色革命Rht1、Rht2基因的克隆 拟南芥GAI 水稻EST 筛选小麦BAC文库 Rht1、Rht2 Blast 探针标记 深远意义 比较基因组研究已使得传统的植物遗传学突破了物种的框架限定，发展成了新的系统遗传学。 随着最近一些生物的基因组全序列的获得，比较基因组研究也随之步入了一个新的时代。 研究基因表达与调控 传统方法是利用cDNA文库筛选和Northern杂交。 AFLP研究基因表达是非常有效的方法，可同时比较植物发育的不同时期以及分离某些重要基因（cDNA-AFLP）。 利用cDNA-AFLP的方法，阐明了马铃薯块茎在不同发育阶段基因表达的情况，并克隆了2个与块茎脂肪氧合酶高度同源的cDNA片段（Bachem等1996） 。 在植物育种上的应用 在杂交育种中，单单根据育种材料的表型特点选配亲本，往往会受到环境条件的干扰。 辅之以DNA分子标记的差异性分析，将使得亲本选配更为快速、准确，从而提高育种效率。 揭示育种材料之间的亲缘关系 杂种优势利用正成为许多作物提高产量和改善品质的重要途径。 对遗传差异与杂种优势关系的评价方法经历了从形态性状遗传距离，到生化标记遗传差异，亲缘系数，以及分子标记遗传差异等各种尝试。 杂种优势预测及机理研究 DNA分子标记的应用，使得能够在整个基因组范围内对大量亲本材料间的遗传距离进行估测，并在此基础上有效地预测具有强优势的组合（Smith等，1992；Bernardo，1994）。 结果：既有相关性很高的报道，又有完全相反的结果。 张启发认为： 分子标记杂合度与杂种优势的相关性因遗传材料而异，在经过改良的优良种质中，两者之间高度相关，而在一些未经改良的优良种质中，相关程度很低。 提出了“上位性是杂种优势的主要遗传基础”的重要观点。 应用cDNA－AFLP技术进行杂种优势机理的研究表明，强优势与弱优势组合间基因表达有明显差异，有增强型、减弱型和沉默型。 杂种优势表现与单亲沉默、双单亲沉默有密切关系。 大量研究表明，虽然分子标记揭示的遗传距离与杂种优势的关系比较复杂，但亲本之间的遗传差异是产生的主要原因。 通过对与杂种优势相关QTLs效应的研究，可以加深对杂种优势机理的了解。 我国玉米种质基础 亚群 类群 标准测验种 四平头 Dom 黄早四 旅大红骨 丹340 BSSS A B73 PA 掖478 Lancaster B Mo17 PB 齐319 分子标记辅助选择（MAS,marker assisted selection) 分子标记辅助选择几乎不受环境条件的影响，还可以跟踪外源基因，克服回交的缺点，可大大提高选择的效率。 长期以来，选择都是基于植株的表型性状进行的。植物的许多性状为数量性状，受许多微效基因的控制，且易受环境的影响。 快速有效地选择出带有目标基因的单株 表现在: 1.不受环境条件及生长发育阶段的影响，在苗期或低世代就可进行筛选; 2.利用共显性标记可直接对隐性目标基因进行选择，无需测交或自交检验; 3.如果目标性状不能在当代进行选择，采用MAS可直接在当代确定。 快速选出以轮回亲本为遗传背景的单株 在回交育种中不仅要考虑优良性状的导入，还必须考虑保持其整个基因组的遗传背景基本不变。 通过MAS技术，借助于饱和的分子标记连锁图，对各选择单株进行整个基因组的组成分析，进而可以选出带有多个目标性状而且遗传背景良好的理想个体。 当回交转移性状由隐性基因控制时，需在选择前先自交一代使其纯合化；而且当选择的是如抗病这样的性状时，还要借助于繁琐的接种鉴定等。 贾继增等（2001）根据AFLP标记进行小麦白粉病抗性的回交选择，对小麦的外源染色质及基因可以进行准确的跟踪鉴定，从而加速种质创新的进程。 计算机模拟表明： 如果从每个回交世代含有目标基因的30个的单株中，通过MAS选出1株带有轮回亲本基因组比率最高的个体作为下一次回交的亲本，则完全恢复到轮回亲本基因组的基因型只需3代。在传统育种方法中，要达到99%轮回亲本比率则需6.5代（Tanksley等1998）。 通过对Opaque-2基因中开发的SSR引物，以及与Opaque-2共分离的RFLP标记，我们正在进行QPM分子标记辅助育种。 基因聚合 将多个有利基因通过选育途径聚合到一个品种之中,这些基因可以控制相同的性状也可以控制不同的性状。 基因聚合突破了回交育种改良个别性状的局限,使品种在多个性状上同时得到改良。 数量性状遗传改良 由于数量性状遗传的复杂性，存在