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在细胞质中所有的RNA都要受到降解控制(degradation control)。 不同mRNA降解效率的不同, 加入调节物可以增加mRNA稳定性,并使相关基因转录速率增加 mRNA的选择性降解主要由于核酸酶和mRNA内部结构相互作用的结果。 (教材P.335) 三、mRNA的结构和翻译的效率 5’m7G帽结构是否存在和是否易于接近eIF-4F的程度对翻译效率有着明显的影响。 起始密码子AUG的位置和其侧翼的序列对翻译的效率也有影响。 5’端非翻译区的长度也会影响到翻译的效率和起始的精确性,当此区长度在17~80Nt之间时,体外翻译效率与其长度变成正比。 在5’UTR中存在碱基配对区时,可以形成发夹式或茎环二级结构,这类结构会阻止核糖体40S亚基的迁移,对翻译起始有抑制作用。 1、mRNA5’前导序列对翻译水平的影响 2、mRNA3’端的结构对翻译速率和mRNA寿命的影响 mRNA 3′端的poly(A)不仅和mRNA穿越核膜的能力有关,而且影响到mRNA的稳定性和翻译效率。 poly(A)越长mRNA作为模板的使用的半衰期越长。 poly(A)对翻译的促进作用是需要PABP(poly(A)结合蛋白)的存在。 四、翻译的起始调节 翻译起始因子eIF-2磷酸化,磷酸化后不能重复利用,从而选择性地降低或加强一些mRNA的翻译。 当细胞处在异常环境(如饥饿、pH变动、重金属处理、加入化学药品等)或蛋白质生物合成受抑制时,都可以检测到细胞内eIF-2的磷酸化作用。 (教材P.329-332) 图18-46 图18-47 五、选择性翻译 珠蛋白是由两条α链和两条β链组成的。 在二倍体细胞中都有4个α,2个 β; 如果它们相同转录和翻译的话它们之间的浓度比应是α:β=2:1,而实际上是1:1,α珠蛋白和β珠蛋白是在翻译水平上存在的差异,即和翻译起始因子的亲和性不同。 2、锌指(zinc finger) Zn2+与4个Cys 、或2个Cys和2个His相结合。 整个蛋白质分子有2-9个锌指重复单位。 每一个单位的指部伸入DNA双螺旋的深沟,接触5个核苷酸。 (教材P.301-303) (1)I型锌指:2Cys / 2His ~23aa Cys- X2-4- Cys-X3-Phe- X5 -Leu- X2 -His- X3 -His Cys,His与Zn2+结合形成4面体结构,使中部的氨基酸回折成环,凸出如手指 中部芳香族氨基酸保守,疏水 串联重复排列,两指间7-8aa 锌指数目多少不等 与GC盒结合的转录因子SP1中有连续的3个锌指重复结构。 SP1 TF III A 344aa,N端与DNA结合 9个锌指,每个~30aa 与5s rRNA基因内启动子 (50bp)结合 (2)Ⅱ型锌指:4Cys 保守序列为: Cys- X2- Cys-X13-Cys- X2- Cys Zn2+与4个Cys结合 DNA结合序列较短,对称 无大量重复性锌指 Cys2/Cys2与 Cys2/His2不同 例如GAL4,酵母的转录因子,哺乳类的固醇类激素受体 糖皮质激素特异性 雌激素特异性 类固醇激素受体是以二聚体形式发挥其促进转录作用的。它们的两个锌指的功能不同。 第1个锌指的右侧是控制与DNA结合的,第2个锌指的左侧则是控制形成二聚体的能力的。 3、同源域(Homeodomain) 最早在果蝇的homeotic loci(决定身体结构)中发现同形异位现象(homeosis): 果蝇头部长触角部位长出脚来。 同形异位盒基因(homeobox) : 高度保守的一段核苷酸序列(180bp), 控制胚胎发育的基因。 从酵母到人类都存在; homeobox, DNA序列高度保守。 (教材P.304-305) Homeodomain 有3个?—helix, H1与H2平行 H2与H3形成HTH motif H3位于大沟中,与DNA特异结合 N末端位于小沟中,与DNA接触 HD与HTH的不同: (1)HD的C端由3个α-螺旋构成,螺旋3结合于大沟;而HTH至少2个α-螺旋构成; (2)HTH以二聚体形式与DNA结合,而HD是以单体形式与DNA结合。 -COOH,每隔6个氨基酸出现一个Leu,所有Leu出现在同一侧面,成直线排列,形成疏水面 依靠Leu的疏水作用,2个helix 相互缠绕,形成拉链结构 -NH2,富含碱性氨基酸,螺旋状,+,碱性DNA结合域, 与DNA双螺旋链上带负电荷的磷酸基团结合 4、碱性-亮氨酸拉链(basic leucine zipper, bZIP) (教材P.303-304) 5、碱性螺旋--环--螺旋(basic h
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