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Ribosome is a ribozyme 大部分的核糖体蛋白,特别是那些大亚
基核糖体蛋白,都有手指状的突起伸到
rRNA核心内以稳定rRNA的结构。核糖体
蛋白对亚基的rRNA核心起着修饰的作用。
核糖体的功能中心是富含RNA的,亚基
相互作用的主要位点也是由RNA组成,
而核糖体蛋白只在一些小的和更外周的
位点形成中发挥作用 。
解码位点和肽酰转移酶中心都没有蛋白 现在发现在翻译的各阶段均有rRNA的参与,
成分 。现在已经确定,距离肽酰转移酶 rRNA的正确结构是蛋白质发挥催化功能所
中心最近的核糖体蛋白没有催化作用, 必需的。在翻译起始过程中,rRNA的3’端直
它们的功能主要是维持活性位点的构象。 接与mRNA作用;16S rRNA在A和P位直接
与反密码子作用;23S rRNA与肽酰-tRNA的
尽管核糖体的解码和肽酰转移酶中心以 CCA端直接作用;大小亚基的结合可能涉及
RNA为主,核糖体蛋白也发挥着非常重 到16S和23S rRNA 间的碱基配对关系。
要的作用。没有了蛋白成分,核糖体既 在翻译的各个阶段,抑制翻译的抗生素几乎
不能装配也不会发挥其功能。 都作用于rRNA ,说明了rRNA的重要性。
16S rRNA的二级结构可以分为三个各自
独立的折叠结构域:5’、3’和中央结构域,
最大限度的分子内碱基配对使它成为最
稳定的分子。
16S rRNA的二级结构确定以后,其三维
排布以及在完整的核糖体亚基内与核糖
体蛋白位臵之间的关系成为分子生物学
家急需回答的问题。
1
核糖体的活性位点
核糖体可以分为翻译区域 (translation
domain )和逐出区域 (exit domain ),翻
译区域占2/3 ,逐出区域占1/3,与膜系
统结合。
30S亚基与mRNA的结合需要S1蛋白。S1 16S rRNA部分位于A位,它在1392 ~1407有一
蛋白和S18与S21组成一个活性区域,位 保守区,称为1400区。肽酰-tRNA和氨基酰-
于小亚基的峡部,参与起始tRNA识别 tRNA均与该区域结合。
AUG 。
转肽酶活性位点已被嘌呤霉素定位,包括23S
rRNA和几种蛋白质。
S1蛋白对单链核酸有很强的亲和力,并 EF-G位点位于50S亚基,和EF-Tu位点连接在
能阻止mRNA形成分子内的二级结构,
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