神经元几何形态特征参数的MATLAB实现.docVIP

总第 257 期2011 年第 3 期 总第 257 期 2011 年第 3 期 计算机与数字工程 Co mp ut er Digital Engineering Vol . 39 No . 3 36 3 神经元几何形态特征参数的 MATL AB 实现 詹 君 (南京财经大学应用数学院 南京 210046) 摘 要 神经元的几何形态特征可以描述神经元的功能特征 ,在神经元分类的过程中首先要对神经元的基本特征进 行定义计算 。根据对神经元几何形态的认知 ,定义了神经元各几何形态特征 ,例如树数目 ,干数目 ,分叉点数 ,整体形态 ,内 部形态等 。利用 MA TL AB 软件计算神经元各几何特征的参数值 ,并与已知样本进行数据比较 ,误差较小 。 关键词 神经元 ; 形态特征 ; MA TL AB 软件 中图分类号 T P31 Ca l c ul a t e t he Geo met r y Morp h ol ogi c a l C h a r a ct e ris t ics of a Ne u r on by MA TL AB Z h a n J u n ( School of Applied Mat hematic , Na njing U niver sit y of Finance and Eco no mic s , Na njing 210046) A b s t r a c t The geo met r y mo rp holo gical characteri stic s of a neuro n ca n de scribe it s f unctio nal characteri stic . Itπs usuall y p ut t he neuro nπs definitio n and calculatio n fir st in t he p roce ss of neuro nπs cla ssificatio n. Define kinds of geo met r y mo rp holo gi2 cal cha racteri stic s acco r di ng to t he realizatio n of neuro nsπ geo met r y mo rp holo gical cha ract eri stics , such a s t ree , bra nch , bi2 f urcate , w hole mo rp holo gy , local mo rp holo gy and so o n. MA TL AB ca n calculate t he geo met r y mo rp holo gical cha racteri stics of neuro n , t hen co mp ared wit h al ready kno w n dat a wit h lesser residual . Ke y W o r d s neuro n , geo met r y mo rp holo gical characteri stic s , MA TL AB sof t wa re Cl a s s N u m b e r T P31 1 神经元几何形态特征 1 . 1 神经元的相关概述 作为大脑构造的基本单位 ,神经元的结构和功 能包含很多因素 。经发现 ,神经元的几何形态特征 可以描述神经元的功能特征 ,其具体包含接受信息 的树突 ,处理信息的胞体和传出信息的轴突三部分 结构 。 从定义神经元的各项特征入手 ,几何刻画神经 元空间几何形态 。例如神经元的胞体表面积 ,分叉 数目 、分支数目 、宽度 、高度 、深度 、长度 、表面积 、体 积 、欧式最远距离 、路径距离以及破碎度等[ 1 ] 。 1 . 2 有关特征的假设 1) 树突不会长闭环形 ; 2) 房室为圆柱体 ,胞体为球体 。 2 神经元各项特征的 MATL AB 实现 2 . 1 分析神经元房室数据的结构 一个神经元根据形态空间结构可以离散为很 多房室 ,这些房室用数据描述 。数据的每行包含有 神经元一个房室的 7 个标准数据点 : 1) 一个房室的标号 ; 2) 房室的类型 ( 例如 02待定 ,12胞体 ,22轴突 , 32树突 ,42尖端树突等) ; 3) ～5) 房室的 x 坐标 , y 坐标 , z 坐标 ; 6) 房室的半径 ; 7) 与该房室连接的母房室标号 。 例如 :全国研究生数学建模竞赛 C 组数据库中 包含大量神经元的几何形态数据[ 2 ] ,选取一些关于 神经元的房室