微生物学通报不同能量代谢率的山羊瘤胃微生物结构与.pdfVIP

微生物学通报 Jan. 20, 2018, 45(1): 91−101 Microbiology China /wswxtbcn tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.170185 研究报告 不同能量代谢率的山羊瘤胃微生物结构与组成的差异性 金磊 周美丽 王禄禄 刘凯珍 王立志* ( 625014) 摘 要：【背景】能量代谢率是衡量饲粮利用效率的一个重要组成部分，提高反刍动物对不同营养 物质所含能量的消化代谢率，有助于提高反刍动物对能量的利用效率。【目的】通过高通量测序技 术比较不同能量代谢率的山羊瘤胃微生物结构与组成的差异。【方法】以19 只山羊作为试验动物， 通过代谢试验和呼吸测热试验筛选出高能量代谢率表型组(HEU)和低能量代谢率表型组(LEU) 山羊 各 5 只。分别采集HEU 、LEU 组每只山羊瘤胃内容物，提取微生物总DNA ，用细菌通用引物对 细菌16S rRNA 基因的高可变区进行PCR 扩增，利用Illumina MiSeq 平台对扩增子进行高通量测 序，并用QIIME 等软件对测序序列进行生物信息学分析。【结果】拟杆菌门(44.20%±9.39%)、厚壁 菌门(16.40%±5.44%)和变形菌门(11.30%±7.42%)在两组山羊瘤胃微生物中均为优势菌门，其中厚壁 菌门是两组中共享的优势菌门。LEU 组(6.71%±2.47%) 中芽孢杆菌纲相对丰度显著高于 HEU 组 (P0.05)。两组相对丰度最高的目均为乳酸杆菌目，LEU 组(4.98%±1.88%)乳酸杆菌目相对丰度显 著高于HEU 组(P0.05)。在科水平，有7 个科的相对丰度在组间差异性显著(P0.05)。拟杆菌科在 两组中均为相对丰度最高的科，LEU 组(3.64%±1.32%)拟杆菌科的相对丰度显著高于 HEU 组 (P0.05)。在属水平，有9 个属的相对丰度在组间差异性显著(P0.05)。HEU 组(0.61%±0.36%)仅有 普雷沃氏菌属的相对丰度显著高于LEU 组(0.16%±0.07%)，其他8 个属的相对丰度均显著低于LEU 组(P0.05)。其中瘤胃球菌属在HEU 组(2.53%±0.62%)和LEU 组(4.19%±1.43%) 中均为相对丰度最 高的属。【结论】不同能量代谢率的山羊瘤胃微生物结构与组成存在显著性差异。 关键词：山羊，能量代谢率，Illumina MiSeq ，微生物 Differences of microbial structure and composition in goat rumens with different energy metabolism efficiency * JIN Lei ZHOU Mei-Li WANG Lu-Lu LIU Kai-Zhen WANG Li-Zhi (Animal Nutrition Institute, Sichuan Agricultural University, Ya’an, Sichuan 625014, China) Abstract: [Background] Energy metabolism efficiency was an important component of measuring the utilization rate of the diet. Improving the digestion and metabolism efficiency of the energy contained in