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计算化学 第二讲 有机化学反应机理的理论模拟 例子 密度泛函理论方法(DFT) B3LYP、 BLYP、 BPW91、 BP86、 X3LYP、PBE0PBE etc M06、M06L、M05X etc 分子轨道方法 CASSCF、MP2、CCSD、CCSD(T) 半经验方法(semi- empirical) AM1、PM3、PM6 etc 分子力学(molecular mechanic) Amber、UFF etc 基组(basis sets) 基组(basis sets) 结构优化的输入文件 原子坐标的产生 关键词scfcon和scfcyc Cycle 1 Pass 1 IDiag 1: CalDSu: requested number of processors reduced to: 7 ShMem 1 Linda. E= -460.795694013798 DIIS: error= 3.66D-05 at cycle 1 NSaved= 1. NSaved= 1 IEnMin= 1 EnMin= -460.795694013798 IErMin= 1 ErrMin= 3.66D-05 ErrMax= 3.66D-05 EMaxC= 1.00D-01 BMatC= 2.49D-08 BMatP= 2.49D-08 IDIUse=1 WtCom= 1.00D+00 WtEn= 0.00D+00 Coeff-Com: 0.100D+01 Coeff: 0.100D+01 Gap= 0.342 Goal= None Shift= 0.000 RMSDP=1.39D-05 MaxDP=9.16D-05 OVMax= 9.76D-05 Cycle 2 Pass 1 IDiag 1: CalDSu: requested number of processors reduced to: 7 ShMem 1 Linda. E= -460.795694051223 Delta-E= -0.000000037425 Rises=F Damp=F DIIS: error= 1.11D-05 at cycle 2 NSaved= 2. NSaved= 2 IEnMin= 2 EnMin= -460.795694051223 IErMin= 2 ErrMin= 1.11D-05 ErrMax= 1.11D-05 EMaxC= 1.00D-01 BMatC= 3.39D-09 BMatP= 2.49D-08 IDIUse=1 WtCom= 1.00D+00 WtEn= 0.00D+00 Coeff-Com: 0.210D+00 0.790D+00 Coeff: 0.210D+00 0.790D+00 Gap= 0.342 Goal= None Shift= 0.000 RMSDP=4.50D-06 MaxDP=4.37D-05 DE=-3.74D-08 OVMax= 1.76D-05 SCF Done: E(RB+HF-LYP) = -460.795694051 A.U. after 2 cycles Convg = 0.4500D-05 -V/T = 2.0030 S**2 = 0.0000 关键词 optcyc=100 结果的验证-频率分析 判断依据:反应物、中间体、产物没有虚频 过渡态有且只有一个虚频 各种能量的获取 势能面的构建 * 19.6 ???? ???? all but Fr and Ra SDD, SDDAll ???? ???? H, Li-La, Hf-Bi LanL2DZ ???? ???? H-La, Hf-Bi LanL2MB ???? +,++ ???? (d) or (d,p) H-Ne D95V ???? +,++ ???? through (3df,3pd) H-Cl except Na and Mg D95 ????6-311+G* +,++ ????6-311G* through (3df,3pd) H-Kr 6-311G ????6-31+G* +,++ ????6-31G* through (3df,3pd) H-Kr 6-31G ???? ???? * or ** H-Ne 4-31G ???
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