人类疾病网络报告资料.ppt

方法： 考虑一对疾病D1和D2，模拟一个人在特定年龄或之前的表型。一个人天生带有（没有）疾病易感变化集合，用k1、k2和k12的随机变量表示，这些变量确定了某个人在某个时间被诊断为某种病的概率。 如果没有时间的调节，早发疾病和晚发疾病可能被错误的判断为负关联。 假设 1）如果有两种（多种）不同疾病是在相同环境下发生的，那么它们通常是通过分子机制引发的。 2）对于每个表型对D1和D2，整个人类基因组被分为四个不相交的核苷酸位点集合。 3）涉及连接疾病表型的四个 集合中遗传变异的假设机制。 在位点的疾病易感集合中，遗 传变异的数目越大，疾病表型 越可能显现出来。 这儿考虑两类遗传外显率函数：和。 是指当多态性的数目超过阈值 时，表现出表型i的特征来。 是指表现疾病表型i所需要的，在疾病特异性核苷酸位点的有害多态性的最少数目。 是指，阈值是一个随机变量，满足均值为 ，方差为 的二项分布。（ ） 对每一个疾病对，我们选择三种模型中的一种进行分析：二者不相关（也就是没有遗传重叠）；二者负相关（竞争遗传重叠）；二者正相关（合作遗传重叠）。 合作模型比标准的遗传多效模型更一般。因为合作模型除了分享的多态性，还允许关联影响各自的遗传多态性。 独立模型是两个重叠模型的特殊情况，我们通过将两个重叠模型同独立模型比较，用两