血管切片的三维重建.docxVIP

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血管切片的三维重建 摘 要 本文利用血管 100张切片图,通过分析其几何特性 , 给出了确定其管道中轴线和半径的数学模型,并进行了血管的三维重建。 对血管的三维重建问题, 本文假定血管为等径管道, 管道的表面是由球心沿着某一曲线(称为中轴线) 的球滚动包络而成。 首先读取 100张血管切面图 , 把它们转换成二值矩阵 , 提取出边界矩阵、骨架矩阵,通过搜索每个切片截面最大内切圆 , 该内切圆圆心即为切片截面与管道中轴线的交点 , 内切圆半径即为管道半 , 再通过对各个交点进行曲线拟合求出中轴线方程。利用多项式拟合进行了中轴线在三平面上投影的精确定位。 本文较好的进行了三维血管的重建 , 得出所求平均半径为 29.49,100 张切片最大内切圆的圆心坐标见表 1, 通过建立空间三维曲线的参数方程, 将Z作为参数,再用 MATLAB中的 polyfit 函数,选取适当的拟合次数,使偏差平方和尽量小,但 拟合多项式的最高次数不能太高,分别进行 X,Z和Y,Z的多项式拟合,从而得到中轴线的参数方程, 再对 X,Y进行多项式拟合, 最终得到中轴线及其在 XY , YZ 和 XZ 平面上的投影图、散点图。 本文最大的亮点, 对所建模型进行了很好的检验, 在所求中轴线方程的基础上,求得血管空间曲面方程,令 Z=0:1:99 ,对其进行切割,得到新的截痕,再对截痕内部进行填充,得到 100张拟合三维血管管道新的平行切片图像。本文定义了重合度,通过计算新切片与原对应切片坐标相同点的个数所占百分比, 计算重合度,最终所求最高重合度为 80.25%,验证了模型的正确性。 关键词: MATLAB图像处理;图像骨架;最小二乘曲线拟合;三维重建;重 合度 问题重述 断面可用于了解生物组织、 器官等的形态。例如将样本染色后切成厚约 1 m 的切片 , 在显微镜下观察该横断面的组织形态结构。如果用切片机连续不断地将样本切成数十、成百的平行切片 , 可依次逐片观察。根据拍照并采样得到的平行切片数字图象 , 运用计算机可重建组织、器官等准确的三维形态。 假设某些血管可视为一类特殊的管道 , 该管道的表面是由球心沿着某一曲线 ( 称为中轴线 ) 的球滚动包络而成。例如圆柱就是这样一种管道 , 其中轴线为直线 , 由半径固定的球滚动包络形成。 现有某管道的相继 100张平行切片图象 , 记录了管道与切片的交。 图象文件名依次为 0.bmp、1.bmp、 、99.bmp, 宽、高均为 512个象素 (pixel) 。为简化起见 , 假设 : 管道中轴线与每张切片有且只有一个交点 ; 球半径固定 ; 切片间距以及图象 象素的尺寸均为 1。 取坐标系的 Z轴垂直于切片 , 第1张切片为平面 Z=0,第100张切片为平面 Z=99。 试计算管道的中轴线与半径 , 给出具体的算法 , 并绘制中轴线在 XY、YZ、 ZX 平面的投影图。 模型假设 1)假设样本血管可视为一类特殊的管道, 该管道的表面是由球心沿着某一曲 线的球滚动包络而成,球半径固定。 2)医学上 , 血管不存在严重扭曲。 3)假设管道中轴线与每张切片有且只有一个交点, 即将切片视为无厚度的切 平面。 4)假设切片间距以及图像像素的尺寸均为 1。 5)假设管道中轴线处处连续,且充分光滑。 6)假设两点间距离舍入服从“四舍五入”原则。 7)中轴线上任两点处的法截面圆不相交。 符号说明 M i : 第 i 张切片的位图信息矩阵,为方便起见,有时也称其为第 i 个切平面; x X z :管道中轴线参数方程,其中 0 z 99 ; y Y z :管半径,即沿中轴线滚动球的半径; Pi  :中心点,即管道中轴线与第  i  个切平面的交点,根据上述方程可知 Pi  X (i ),Y (i )  ,其中  0  i  99 ; SPi:Pi 的候选点的集合, 为定义在某切平面  M i 上所有被判定为最大圆面  (r  R) 的圆心; SP : SP SPi,所有候选点的集合; 模型建立及求解 4.1. 问题分析 问题第一部分需要求出管道的中轴线方程和半径 , 第二部分需要绘制中轴线在各个平面上的投影。 解决问题第一部分的关键在于发现以下定理: 定理:在一条粗细均匀血管的任何横截面的图象内, 其包含的最大内切圆的 圆心 Pi 位于中轴线上,该圆的半径等于滚动球的半径 R 。 基于: 1)球的任意截面都是圆 2)经过球心的球截面是所有截圆当中半径最大的圆 【证明】:假设中轴线上存在另一点 P ,以其为球心,以 R为半径作球,则 该球与此切平面相交成的圆面的半径不大于 R,若为 R,则可知 P 与此切平面的 距离为 0,换句话说, P 在此切平面上。这与题设中轴线与每个切平面有且只有 一个交点矛盾。 因此

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