第五章 DNA的损伤与修复.pptVIP

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第五章 DNA双螺旋结构发生的任何改变。 DNA存储着生物体赖以生存和繁衍的遗传信息,维护DNA分子的完整性对细胞至关紧要; 碱基类似物 5-溴尿嘧啶(5-Bu) 突变的效应 错义突变(missense mutation)是指碱基替代后mRNA中编码某种氨基酸的密码子变成编码另一种氨基酸的密码子,从而使多肽链的氨基酸种类和序列发生改变。 单碱基对的置换后形成新的密码子,编码另一种氨基酸,最终产生另一种蛋白质,有可能影响、改变或丢失原有蛋白质产物的功能,或获得新的功能。 同义突变(samesense mutation):碱基对发生替换后,mRNA中密码子发生改变,但编码蛋白质中相应位点的氨基酸不发生改变,也叫沉默突变。 无义突变(nonsense mutation)是由DNA的碱基突变使mRNA中编码氨基酸的密码变成终止密码UAA、UAG或UGA。 在相应位点会导致翻译提前终止,产生一条没有功能的缩短的多肽片段,通常对蛋白质的功能有严重的影响。 如GGA(甘氨酸 ) UGA(无义终止密) 移码突变(frameshift mutation) DNA分子中,编码区碱基缺失或增加非3的倍数,造成之后的一系列密码子发生移位的现象。 粘性末端的意义: (1)DNA连接便利 不同的DNA双链,只要粘性末端碱基互补就可以连接,且连接效率高于平末端 同一个DNA分子内连接,通过两个相同的粘性末端,可形成环形分子。 (2)5’末端标记 突出的5’末端可以用DNA多核苷酸激酶进行32p标记; 突出的3’末端可以用末端转移酶添加几个多聚核苷酸的尾巴 (3)补齐成平齐末端 根据需要,粘性末端可以用DNA聚合酶补平成平齐末端 Ⅱ类限制性酶的酶活性: 限制性内切酶的识别和酶切活性一般在一定的温度、离子强度和PH等条件下才表现最佳切割能力和位点专一性。 所以一般使用专一的反应缓冲液! 如果改变酶的反应条件就会影响酶的专一性和切割效率,称为星星(*)活性。 5.4 基因重组交换的分子机制 本章重点内容 DNA受损的原因 DNA突变的类型 突变修复的几种机制 Ⅱ类限制性内切酶的特点 SOS反应的起始: 诱导信号: 严重的DNA损伤产生大量单链缺口 起始因子: 重组蛋白RecA的水解酶活性被激活 RecA的激活导致阻遏蛋白LexA自我催化引起自身的裂解,同时使许多与修复相关的基因被激活 LexA是一种小分子蛋白,具有蛋白酶活性,是很多操纵子的阻遏物(调控基因的产物)。RecA的激活使LexA的阻遏功能失去活性,从而诱导了它所结合的操纵子结构基因的表达。  和SOS反应有关的基因,包括RecA,lexA, UvrA, UvrB, umuC 和 himA。RecA也触发细胞中其它靶物质的剪切,包括各种原噬菌体的阻遏蛋白。 SOS修复 5.3 限制与修饰 50年代初发现细菌能将外来DNA片段在某些专一位点上切断,从而保证其不为外来噬菌体所感染,而其自身的染色体DNA由于被一种特殊的酶所修饰而得以保护,这种现象叫做限制-修饰 (restriction and modification) 。 大肠杆菌C无限制系统 实验结果: 从3种不同菌株繁殖出来的噬菌体后代,接种到同样菌株,接种率达100%; 如接种到不同菌株上,情况便不同; λ(k)在B株上接种效率只有10-4,λ(B)在 k株上也只有10-4; 如将生存下来的噬菌体接种到第一轮同样的菌株中,如λ(k)→λ(B)→B, 则接种效率为100%。 推论: 大肠杆菌含有一种限制修复系统,限制酶能够将外来DNA切断;修饰酶(甲基化酶)通过将自身腺嘌呤(GATC)或胞嘧啶(CCA/TGG)甲基化对自身DNA进行修饰,因此不会将自身DNA降解掉; 当外来噬菌体进入大肠杆菌后,绝大部分被限制酶所降解,极少数被甲基化酶所修饰而幸存下来;修饰后的噬菌体再进入大肠杆菌,不会被降解。 细菌为对付外来DNA和保护自己DNA而演化来的。 1968年Smith等人从流感嗜血杆菌株中分离出两个内切酶,Hind II和Hind III,为基因工程技术的诞生奠定了基础。 I类限制性核酸内切酶 1)是异源多聚体,包含三个亚基R、M和S,其功能分别为限制性内切酶、甲基化酶和DNA特异位点识别。 2)识别未甲基化的特异序列,切割位点与识别位点相隔1-5kb,切割位点无序列特异性,需ATP,Mg2+和SAM(S-腺苷蛋氨酸) 。 3)种类较少,最早从大肠杆菌的B菌株和K菌株分离得到。 限制性核酸内切酶按照亚基组成、酶切位置、识别位点、辅助因子等因素可划分为三类: III类限制性核酸内切酶 1) III类限制性核酸内切酶由R亚基和MS亚基组成,其中R亚基具有限制性内切酶

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