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;Chapter 1;生物信息学自诞生之日起,计算机似乎就注定要成为其核心工具。
飞速发展的电子计算机技术仍然赶不上生物学科海量信息的快速积累的脚步,光计算机,量子计算机和生物计算机学科成为计算机技术新的发展方向。
互联网汇总着人类的文明,并成为人们生活的主题。
计算机几乎应用在所有学科上,尤其是研究生物大分子的分子生物学和以量化生物为目的的生物信息学。
计算机硬件
计算机网络
系统环境
数据库技术
计算机语言;CPU:体系架构、主频、摩尔定律、多线程、多核心…
内存:容量、运行频率、多通道…
显卡:运行频率、位宽、架构、功率…
内置存储(硬盘):介质、容量、接口…
外置存储:软盘、光盘、优盘、蓝光光盘
;国际互联网
域名系统(gov, edu, org, com…)
TCP/IP协议
HTTP、FTP、Pop3、SMTP、IMAP和BitTorrent
Telnet和SSH;大型机,中型机,小型机和微机。
Server,Workstation,PC,Laptop,mobile
UNIX操作系统以其稳定的计算环境和良好的多用户支持成为企业内部和研究所采用的平台;
MacOS/iOS:早期的Macintosh机由于具有优良的图像支持能力的图形界面环境而广泛应用于图形计算等领域;
Windows 95/98/NT/2000/XP/Vista/7/8:Microsoft的Windows操作系统成为PC上的主流操作系统;
Linux:源代码开放的完全免费的UNIX兼容系统,在生物信息学分析已经显示出巨大的生命力,并成为发展的趋势。从事生物信息学分析的用户一般会同时安装Linux和Windows系统以满足更深入的分析任务,Linux具有很好的兼容性。
Android: 基于Linux深度开发的操作系统(Google),最初目的用于支持手机等移动设备,逐渐扩展到平板电脑、电视、数码相机和游戏机等设备。2012年占据了全球智能手机操作系统市场76%的份额。平台开发的开放性是Android的首要优势,开发者和用户迅速增加。;数据库技术;数据库的基本概念-SQL简介;计算机语言;Composition of Biological Database;Database;Chapter 2;? The NAR online Molecular Biology Database Collection, has;Biological Databases;一.核酸序列数据库;National Center for Biotechnology Information;NCBI 综合检索平台(Entrez);GenBank;GenBank数据来源;特殊标志符的格式 (核酸序列);;Case Study;Search results:;辅助功能;Limited to:;搜索结果减少为8912;GenBank Flatfile;NM_001142673;字段;常见的序列文件格式-Staden;常见的序列文件格式-GCG;常见的序列文件格式-FASTA;常见的序列文件格式-PRI/NBRF;常见的序列文件格式-GenBank;常见的序列文件格式-DNAStar;2. EMBL;3. DDBJ;上机操作;上机操作;Homework
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