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生物检测技术试题集
一、名词解释
引物:PCR 反应过程中的一段与模板链互补,DNA 聚合酶以其作为起始进 行核酸聚合反应的一段短核苷酸序列 。
Sanger reaction:是在近于中性或碱性和室温的情况下, 2,4-二硝基氟化苯 DNP 与蛋白质分子中 N-端氨基酸中的游离 α 氨基生成 DNP 衍生物,浓盐酸加 热水解全部肽键,生成物中有一 DNP 氨基酸。
Tm 值:50%DNA 分子发生变性的温度称为变性温度(即熔解曲线中点对应 的温度),由于这一现象和结晶的熔解相类似,故又称熔点或熔解温度(meltin temperature,Tm)。因此 Tm 是指消光值上升到最大消光值一半时的温度。
DNA 变性:是指核酸双螺旋碱基对的氢键断裂,双链变成单链,从而使核 酸的天然构象和性质发生改变。变性时维持双螺旋稳定性的氢键断裂,碱基间 的堆积力遭到破坏,但不涉及到其一级结构的改变。凡能破坏双螺旋稳定性的 因素,如加热、极端的 pH、有机试剂甲醇、乙醇、尿素及甲酰胺等,均可引起 核酸分子变性。
全基因组鸟枪法测序:将基因组打成小片段后将其克隆到质粒载体中,然后 随机挑取克隆对插入片段测序,并以获得的测序序列构建重叠群。在此基础上 进一步搭建序列支架,最后以分子标记为向导将序列支架锚定到基因组整合图 上。
real-time PCR:是 1996 年由美国 Applied Biosystems 公司推出的一种新定 量试验技术,它是通过荧光染料或荧光标记的特异性的探针,对 PCR 产物进行 标记跟踪,实时在线监控反应过程,结合相应的软件可以对产物进行分析,计 算待测样品模板的初始浓度。
蛋白质一级结构(primary structure):就是蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列 顺序(sequence),也是蛋白质最基本的结构。它是由基因上遗传密码的排列 顺序所决定的。各种氨基酸按遗传密码的顺序,通过肽键连接起来,成为多肽 链,故肽键是蛋白质结构中的主键。
蛋白质的三级结构:是指球状蛋白质的多肽链在二级结构的基础上相互配置 而形成特定的构象。α 螺旋、β 折叠、β 转角和无规则卷曲等二级结构通过侧链 基团的相互作用进一步卷曲、折叠,借助次级键的维系形成三级结构,三级结 构的形成使肽链中所有的原子都达到空间上的重新排布,它是建立在二级结构、 超二级结构和结构域基础上的球状蛋白质的高级空间结构。
宏基因组学(Metagenomics)又叫微生物环境基因组学、元基因组学。它通 过直接从环境样品中提取全部微生物的 DNA,构建宏基因组文库,利用基因组 学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。 10、蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质 的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上 的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识,这个概念最早是由 Marc Wilkins 在 1994 年提出的。
二、填空题
1、核酸分离纯化的技术路线包括破碎细胞、分离除杂、浓缩、分析鉴定以及分 装保存等步骤。
2、质粒 DNA 的分离纯化主要包括:碱裂解法;沸煮裂解法;SDS 裂解法等。 3、DNA 复性不仅受温度、时间影响还受 DNA 浓度以及 DNA 顺序的复杂性影 响。
PCR 根据时间和温度可分为三个步骤,即变性、退火和延伸。
高通量测序技术步骤分为:1. 样本准备(sample fragmentation);2.文库构建 (library preparation);3.测序反应(sequencing reaction);4.数据分析(data analysis)。
基因作图有三种类型,即遗传作图、物理图谱和转录图谱。
比较基因组学是基于基因组图谱和测定基础,对已知的基因和基因组结构进 行比较,从而了解基因的功能、表达机理和物种进化的学科。
由于蛋白质分子结构中特殊的键或基团造成蛋白质具有紫外吸收、蛋白黄反 应、Millon 反应、双缩脲反应、ninhydrin 反应、亚硝酸反应、硫的反应、 sakaguchi 反应、丹酰化反应以及两性电解质等特点。
蛋白质一级结构测定通常是将蛋白质水解、部分水解以及选择性水解,再分 别测定水解产物的组成,包括肽类和氨基酸,以观察组成蛋白质的氨基酸种类、 数目、排列状态和次序等。
氢键是稳定蛋白质二级结构的主要作用力,二级结构包括:α-螺旋(α-helix)、 β-折叠(β-sheet) 、β-转角(β-turn) 和无规卷曲(randon coil) 。
蛋白质高级结构分析测定方法分为仪器分析法和理论分析法。
蛋白质组学检测技术主要包括:电泳分析法;层析技术和质谱技术。
生物传感器是利用生物要素与物理化学检测要素组合在一起对被分析物
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