GEO数据库简介资料.pptVIP

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  • 2020-05-22 发布于湖北
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基因表达谱图 以Fto(肥胖基因)在二型糖尿病与肾脏功能试验中的表达谱为例:从原始样本记录中提取的基因表达值以红色的条形柱表示。蓝色条形柱代表内部样本的百分等级信息,以提供该基因与阵列上所有其它基因相互比较的相对表达水平值。 改变实验条件对数据进行重新排列。 点击各个样本,可以打开相关样本的页面。 * 数据分析工具2 2. Compare 2 sets of samples: 选择比较方式和显著性水平 选择A和B两组样本组 进行A、B样本组的比较 查看两组基因可供比较的表达谱。 * 数据分析工具3 3. Cluster heatmaps 聚类分析图(Cluster analyses are one of the most powerful methods to mine and visualize high-dimensional data. )包含三种聚类算法: 层级聚类方法:(Single-Link:最近距离、Complete-Link:最远距离、Average-Link:平均距离) 分散性聚类方法: K-Medioids算法(特点:用类中的某个点来代表该聚类;优点:能处理任意类型的属性;对异常数据不敏感) K-Means算法 (特点:聚类中心用各类别中所有数据的平均值表示 ;优点:应用最为广泛;收敛速度快;能扩展以用于大规模的数据集;缺点:倾向于识别凸形分布、大小相

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