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微生物功能基因组学
信 息 学 院
陈 玲 玲
llchen@
1
一、微生物基因组数据产生及存储
二、微生物基因组注释及比较基因组学
三、微生物网络构建及分析-药物靶标预测
2
3
Sanger DNA sequencing method
• First developed in 1975 (Sanger won Nobel Prize in 1980)
• Use of terminator chemistry followed by size separation
• Read length: 800 – 1000 bp
• Accuracy: high
• Throughput: low
• Cost: high
• Automated Sanger DNA sequencing technology was the workhorse in
the Human Genome Project
Sanger DNA sequencing
Bioinformatics – HZAU 2014
7
Illumina Solexa DNA
sequencing
HiSeq 2500 MiSeq Benchtop
HiSeq X Ten
10
Pacbio sequencing
PacBio RS II Sequel
@m140604_104052_42208_c100649522550000001823117310071480_s1_p0/58/0_6129 RQ=0.851
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