基因组组装论文.docVIP

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基因组组装 摘要 确定基因组碱基对序列的过程称为测序,该技术始于20世纪70年代,目前正向着高通量、低成本的方向发展。基因组组装就是一种建立在测序技术上的工作。对组装效果的评价主要依据组装序列的连续性、完整性和准确性。 针对问题一:目前能直接读取的碱基对序列长度远小于基因组序列长度,因此需要利用一定的方法将测序得到的短片段序列组装成更长的序列。将基因组复制50-100个复本,无规律地分断成短片段后进行测序,然后寻找测得的不同短片段序列之间的重合部分,并利用这些信息进行组装。测序中可能出现的个别碱基对识别错误、基因组中存在重复片段等复杂情况,本文针对这两中情况,进行对基因组的组装。通过查找文献

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