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第三代基因编辑技术 CRISPR/Cas9 专题内容 基因编辑是指对基因组进行定点修饰的一项新技术 , 可以 精确地定位到基因组的某一位点 , 并剪断靶标 DNA 片段 并插入新的基因片段 基因编辑技术 基因编辑工具 锌指核酸内切酶 （ ZFN ） 类转录激活因子效应物核酸 酶 （ TALEN ） 成簇、规律间隔短回文重复序列 /CRISPR 相关蛋白 9 Clustered regulatory interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9 （ CRISPR/Cas9 ） 基因编辑工具 ZFN TALEN CRISPR/Cas Target Protein: DNA Protein: DNA (gRNA-Cas9): DNA Structure Zinc finger DNA binding motifs in a ββα configuration, the α -helix recognizes 3 bp segments in DNA Proteins containing DNA-binding domains that recognize specific DNA sequences down to the base pair 20nt crRNA (CRISPR RNA) fused to a tracrRNA and Cas9 endonuclease that recognize specific sequences to the base pair Feasibility Difficult: -Need a customized protein for each gene sequence -Low delivery efficiency Easy: - all-in-one gRNA-Cas9 vector system - multi gene editing is feasible Reference Beerli et al ., 1998 Perez-Pinera et al ., 2012 Gaj et al ., 2013 Moscou and Bogdanove, 2009 Boch et al ., 2009 Gaj et al ., 2013 Mali et al ., 2013 Cong et al ., 2013 Jiang et al ., 2015 1987 Ishino Y 等在 K12 大 肠杆菌的碱性磷酸酶 基因附近发 现串联间隔重复序列 2005 三个研究小组均发现 CRISPR 的间隔序列 (spacer) 与宿 主菌的染色体外的遗传物质高度同 源 2002 该结构被正式定义为成 簇、 规律间隔短回文重复序列（ CRISPR ） 2007 Barrangou 等首次发现并 证明细菌可能利用 CRSPR 系统对抗噬 菌体入侵。 2013 Zhang 研究组首次在人 293T 细胞与小鼠 Nero2A 细胞中利 用 Crispr/Cas9 系统实现了基因定点突变。 Crispr/Cas9 研究历史 II 型 CRISPR 免疫 II 型 CRISPR 免疫 Crispr/Cas9 系统核心： Cas9 核 酸酶、 sgRNA CRISPR 系统结构 ( 间隔相邻基序 ) Cas9 切割后的 DNA 修复 编辑效率检测 T7E1 Assays sgRNA 设计 功能 物种数 最大输入长度（ nt ） 网址 CRISPR Design 设计 / 脱靶效 应评估 15 23-500 ZiFiT 设计 / 脱靶效 应评估 9 不限 /ZiFiT Cas9 Design 设计 / 脱靶效 应评估 10 不限 Cas-OFFinder 脱靶效应评估 25 15-25 /cas-offinder E-CRISP 设计 / 脱靶效 应评估 33 不限 /E-CRISP/index.html CRISPR-P 设计 / 脱靶效 应评估 33 23-5000 /crispr CHOPCHOP 设计 / 脱靶效 应评估 23 不限 /index.php GT-Scan 设计 / 脱靶效 应评估