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中国科技论文在线 棉花全基因组WRKY 转录因子的鉴定与表 达分析# 戴鹤，张艳，王省芬，张桂寅，马峙英** 5 （华北作物种植资源教育部重点实验室，河北省作物种植资源重点实验室，河北农业大学， 河北，保定，071001 ） 摘要：WRKY 基因家族是植物基因组内一类重要的转录因子, 参与多种生理生化反应。本 研究利用棉花全基因组数据，结合生物信息学、转录组测序和 Real-Time PCR 试验方法， 10 在全基因组水平对棉花 WRKY 基因家族进行分析。结果表明，从棉花全基因组中鉴定出 110 个WRKY 基因，包括 101 个标准的WRKY 基因和9 个非标准类型的 WRKY 基因。 并对 WRKY 基因进行了基因重复、染色体定位、基因结构、保守基序和系统进化等方面 的分析。棉花 WRKY 基因家族中检测到 12 次基因重复事件, 共涉及 29 个基因, 占全部 WRKY 基因的 26% 。染色体物理定位结果显示, 棉花WRKY 基因在染色体分布不均匀, 存 15 在3 个基因簇。转录组表达普显示，其中有44 个WRKY 基因在黄萎病菌诱导后明显上调， 24 个WRKY 基因在黄萎病菌诱导后明显下调。其余的WRKY 基因中的14 个成员的表达是 先下降后上升的趋势、3 个成员的表达是先上升后下降的趋势、22 个成员的表达变化波动 频繁，没有明显的规律。本研究结果对进一步开展棉花WRKY 基因家族的功能和分子机制 的研究提供了理论基础。 20 关键词：棉花，WRKY 基因，系统进化，黄萎病菌，基因表达 中图分类号：S562 Genome-wide identification and expression analysis of WRKY transcription factors in cotton 25 Dai He, Zhang Yan, Wang Xingfen, Zhang Guiyin, Ma Zhiying (North China Key Laboratory for Germplasm Resources of Education Ministry, Key Laboratory for Crop Germplasm Resources of Hebei, Hebei Agricultural University, Baoding, 071001, China) Abstract: WRKY gene family plays important roles in plant by involving in transcriptional regulations during various physiologically processes. In this study, we systematic analyze the 30 WRKY family using bioinformatics combining RNA-Seq data. We identified 110 WRKY genes, including 101 regular and 9 non-regular type genes. All of these genes were characterized through analyses of gene duplication, chromosomal locations, structural diversity, conserved pro