第十一章微生物分类与鉴定2教学提纲.pptVIP

第十一章 微生物的分类和鉴定;第一节 通用分类单元;分类、命名、鉴定； 培养物、菌株；种、亚种; 微生物命名法； 模式菌株、模式种、模式属－典型培养物保藏中心； ;种(species):是一个基本分类单元,它是一大群表型特征高度相似,亲缘关系极其接近,与同属内的其它物种有着明显差异的一大群菌株的总称. 新种(species nova, sp. nov 或 nov sp.):是指权威性的分类鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过的微生物. 菌株(又称品系,在非细胞型的病毒中称毒株或株):它表示任何由一个独立分离的单细胞(或单个病毒粒)繁殖而成的纯遗传型群体及其一切后代. 菌株的名称可随意确定,与 的概念相同 ;界kingdom(Regnum) 门Phylum(Phylum)或Division(Divisio) 纲Class(Classis) 目Order(Ordo) 科Family(Familia) 属Genus(Genus) 种Species(Species);3、命名: 双名法 学名=属名+种名加词+(首次定名人)+现名定名人+现名定名年份 斜体 正体(一般省略);三名法 学名=属名+种名加词+符号subsp或var+亚种或变种的加词 斜体 正体(可省略) 斜体(不可省) ; 在微生物中,一个种只能用该种内的一个典型菌株当作它的具体代表,此典型菌株就成了该种的模式菌株。;第二节 微生物在生物界的地位;二界 三界 四界 五界 六界 三域; 20世纪70年代末，美国伊利诺斯大学的C.R.Woese等人对大量微生物和其他生物进行16S和18S rRNA的寡核苷酸测序，并比较其同源性水平后，提出了一个与以往各种界级分类不同的新系统，称为三域学说。三个域指的是细菌域（Bacteria）、古生菌域（Archaea）和真核生物域（Eukarya）。 ;Carl Woese;16 S r RNA系统发育树;建立16 S rRNA系统发育树的意义;Carl Woese的rRNA进化树完美无缺？;细菌、古生菌与真核生物重要特性比较;第三节 微生物的分类、鉴定;１、《伯杰氏鉴定细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology);《伯杰氏鉴定细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology);２、细菌分类、鉴定的常用方法的原理;糖发酵试验;VP试 验;甲基红试验;;阳性;H2S试验;尿素酶试验;细菌在液体培养基中的生长情况;细菌在半固体培养基中的生长情况;形态和生理生化特征;肠道菌科细菌属和种 的分类鉴定;选用16S rRNA作为生物进化和系统分类的优点;类芽孢杆菌属基于16S rRNA的系统发育树　;G+C mol%;G+C mol%;DNA-DNA Hybridization;; 国际系统细菌学委员会在1987年规定，当DNA同源性大于等于70%，同时杂交分子的解链温度差即ΔTm值小于等于5℃为细菌种的界限（Wayne et al. 1987）。当然如果鉴定一个新种，除了待定菌与参比菌株之间具有较低的DNA-DNA同源性外，还必须参考16S rDNA序列相似性数值等其它数据。 ;细胞化学成分;　　又称统计分类法是在大量生物个体进行大量性状观察的基础上对研究数据进行收集和计算机处理，计算出所有供试个体之间的相似性，进而在这些相似性的基础上将全部供试个体排列成群．简单地说就是用统计学方法根据大量表型性状将有机体分群．;本章思考题; 细菌的代谢产物;糖发酵试验;VP试 验;甲基红试验;;阳性;H2S试验;尿素酶试验