资料3图解:如何在NCBI上找到HNF-4基因第4个外显子的序列.pptVIP

资料3图解:如何在NCBI上找到HNF-4基因第4个外显子的序列.ppt

  1. 1、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。。
  2. 2、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载
  3. 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
  4. 4、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
  5. 5、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们
  6. 6、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
  7. 7、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
.iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu 如何在NCBI上找到HNF-4基因第4个外显子的序列 .......... * 事实上,在NCBI有很多种办法可以确定某个基因的外显子或者内含子,当然还有UTR区域。今天只介绍一种。通过Blast是一种办法,但不够直观,需要判断的条件要多一些,经验也需要多一些。如果条件允许的话,我们可以借助其它一些专门的软件,让事情变得容易。 .......... * 准备工作 首先介绍NCBI的其中一个软件,Splign /sutils/splign (点击online,在线运行) Splign -通过mRNA或EST序列与所在的基因组序列比对,用于单个基因结构图(外显子内含子)显示, 用户每次只能提交一个基因序列。 .......... * .......... * 进入Genbank页面/genbank/ 或直接进入NCBI主页/ Gene HNF-4 .......... * 查询结果 选择mouse的HNF4基因作为今天的例子 Mus musculus 小家鼠 Hnf4a 点击这里 基因名会随着版本的升级而变化,当然,以前使用过的基因名也会保留着。而基因名会对应一个GeneID,无论名字如何改变,GeneID是唯一的。 .......... * 以下几张都是结果页面 肝细胞核因子4α .......... * Gene mRNA Protein 从图中看出这个基因有10个外显子 .......... * 在HNF-4基因的RefSeq区域,我们将可以看到这个基因的参考序列,有mRNA和编码蛋白质序列。这个区域不一定每个基因都有。NM_开头的序列都是mRNA序列。 .......... * 这里是HNF4基因所在的基因组序列 好像有多个基因组可选。其实它们是不同的人测出的。可以多点几个看看 .......... * 接下来我们进入Splign的online界面(见前),你可以通过mRNA和基因组的Accession或是它们Fasta格式的序列进行对比,要注意基因组的序列不要太长。推荐直接在下拉框选项里选择,一般常用的生物都在。 .......... * .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu .iuu ... ....

文档评论(0)

liuhan98 + 关注
实名认证
文档贡献者

该用户很懒,什么也没介绍

1亿VIP精品文档

相关文档