第五章PCR引物设计课件.ppt

简并引物： 有时需要根据一段氨基酸序列反推到 DNA 来设计 引物，由于大多数氨基酸的遗传密码不只一种，由氨 基酸序列反推 DNA 序列时，会遇到部分碱基的不确定 性。这样设计并合成的引物实际上是多个序列的混和 物，它们的序列组成大部分相同，但在某些位点有所 变化，称之为 简并引物 。 简并度的计算： 例如“ , Ala Asn Ile Lys Met” 的引物 Ala = 4, Asn = 2, Ile = 3, Lys = 2, Met= 1 4 × 2 × 3 × 2 × 1 = 48 使用 步骤及技巧 Preimer Premier 启动界面 复制序列粘贴到此处 进行引物设计时，点击 按钮 如果没有特殊要求， 建议使用默认设置 。 引物长度 引物类型 搜索模式 5 引物位置范 围 3 引物位置范 围 产物大小范围 手动，自动 5 对引物 每对产物的大小 引物分值 100 分为满分 该图分三部分，最上面是图示 PCR 模板及产物位置，中间是所 选的上下游引物的一些性质，最下面是四种重要指标的分析，包 括 发 夹 结 构 （ Hairpin ） ， 二 聚 体 （ Di