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蛋白质组学技术简介 A brief introduction of proteomics technologies 主讲人:彭苑霞 广州辉骏生物科技有限公司 物料学技术学院CPST  蛋白质组学诞生的背景 2蛋自质组学研究的技术 双向电泳2DE 荧光差异双向电泳DGE 体内标记SLAc 体外标记 IITRAQ 3公司简介 植物群学技术学院CPST  蛋白质组学的背景 查的一生过 卿轴虫,畅,虫 个发自阶段 PST  基因组 稳定的,不会随着时间 全部DNA总和 空间、环境的改变而发 what could happen?生变化 转录组 动态的,转录后修饰,随 全部RNA总和 着时间、空间、环境的改 what might be 变而发生变化,但不能代 happening? 表蛋白质表达水平。 蛋白质组 动态的,翻译后修饰,随着 柴 全部蛋白质总和时间、空间、环境的改变而 what is happening?发生变化 植料学技术学院CPST  蛋白质组学研究的应用 药物处理VS对照 阐明药物作用机制,寻找新的药物作用靶点; 疾病VS正常 用于寻找疾病相关的蛋白质标志物,研究疾病发病机制; 髙产植株S低产植株、抗病植株VS非抗病植 作物改良、植物抗病机制研究; 蛋白质磷酸化研究、蛋白质乙酰化研究、 蛋白质相互作用研究 学院 CPST  二、蛋白质组学技术 ITRAQ SILAC DIGE 2 DE 物科学术学院CPST  2DE原理 ·双向电泳(2DE) 第一向:等电聚焦:以蛋白质的等电点差异进行分离 第二向: SDS:根据蛋白质分子量大小差异进行分离。 pl 3(+ umm0Lpl 10( pl 3(+m 00 pl 10(-) pl 3( pl10(-) 通电 3( pl10(-) 应用广,几乎可适用于所有物种,但对低丰度蛋白、极小、 CPST 极大、极酸、极碱、难溶性蛋白难以分离。  实验样本 B D 当和 A小鼠脑组织B血清C动物细胞D拟南裤松科和学院 CPST  客户文章 Proteomics2011.11PROTEOMICS Protein expression profiling in the zebrafish(Danio rerio embryos exposed to the microcystin-LR 目的:探讨囊藻毒素(McLR的毒性作用机制,寻找其毒性作用靶 点 Zebrafish embryos MCLR exposure 2 DE proteomics analysis and 40 proteins were identified WB and RT-qPCR analysis 9 proteins are correlation withCPST MRLR toxic mechanism  D|GE原理 荧光差异双向电泳(DIGE) DGE:用三种荧光染料(Cy2、cy3、Cy5)标记不同组别的蛋白。其 中Cy3和Cy5分别标记两组蛋白,Cy2标记所有组别蛋白的混合物,作为 内参使用。在激光扫描仪中用三种不同波长的激光进行扫描,在同一张 凝胶中可得到三组蛋白的图谱。 DGE的应用范围基本与2DE相同。