【培训课件-临床基因组学】_染色体芯片技术在临床遗传病诊断的应用-广州医学大学.ppt

15三体 病例2 反复流产7次； 以往胎儿出现唇腭裂，并夭折 chr8p12-pter缺失 CNV大小：31.8Mb 病例3 女 26岁 流产 整套染色体UPD 病例4 第一胎为36周妊娠，胎心持续性逐渐减慢，终止妊娠。 第二胎，26周妊娠，B超提示胎儿心脏发育异常、法四可能性大。 chr22q11.21 缺失 CNV ：2.9Mb DiGeorge综合征：先天性心脏病、唇腭裂、特殊面容，智力低下，发育迟缓 病例5 24周 宫内发育迟缓 多发畸形 先心病 chr 9q34.3 1.5Mb 缺失 Kleefstra综合征：智力低下，发育迟缓，肌张力低下，特殊面容，多发畸形，先天性心脏病，泌尿生殖系统畸形，呼吸道感染，癫痫 16q23.2q24.3重复 CNV大小：9Mb 16q部分三体综合征：发育迟缓，先天性心脏病，面容异常，呼吸系统异常，骨骼肌肉系统发育异常，尿道下裂等。 mother 9q34.3 FISH 检测结果 father father mother 16q23.2q24.3 FISH 检测结果 产后遗传病病例分享 病例1患儿，男，6岁智力低下发育迟缓特殊面容睡眠障碍，行为异常，对疼痛和温度不敏感听力差，声音嘶哑 基因芯片结果 chr17p11.2 3.6Mb缺失 诊断：Smith-Magenis Syndrome 临床表现：发育迟缓，轻度到中度智力低下，语言发育迟缓，特殊面容，行为异常 病例2 患儿，男，4岁 智力低下(中度) 不会说话，不与人交流 发育迟缓：8个月会坐，1岁7月走 多动，肌张力低下 夜间磨牙，不明原因发热， 行为异常，喜咬手指 临床诊断：自闭症 芯片诊断：染色体22q13.3-qter 缺失 903Kb Phelan-McDermid Syndrome 临床表现：自闭症、发育迟缓、中到重度智力低下、肌张力低下、语言障碍，可伴有癫痫和行为异常，特殊面容 father mother FISH 检测结果 proband 病例3 患儿，男，1岁9月 头围47cm,身长85cm，体重10Kg 运动发育迟缓(不能独坐) 语言发育迟缓(不会叫爸妈) 自闭症 对疼痛不敏感，胃肠功能紊乱 肌张力低下 癫痫 Mar不知来源 芯片诊断： 15q11.2q13.1 四个拷贝重复 Interstitial dup(15)综合征 临床表现包括：生长发育迟缓，语言发育迟缓，智力低下，癫痫，自闭症，肌张力低下等 proband father mother 病例4 男 2岁 生长、运动、语言发育明显落后：不能独走，不会叫爸爸妈妈 喂养困难，低体重（7.5kg）,身高（66cm） 大头畸形(52cm) 骨骼系统发育不良，脊柱弯曲 手脚短 Sequencing FGFR3：软骨发育不全 测序结果： 1138GA Gly380Arg achondroplasia 基因芯片检测结果： 7p12.1 dup 574kb GRB10 诊断：Russel silver syndrome IGF125.0ng/ml IGFBP3=1.78ng/ml 病例5患儿，男，9月运动发育迟缓：3.5月抬头，8月坐 语言发育迟缓：至今没有意识叫爸妈生长发育迟缓：小头畸形，耳位低，双手、脚，拇指/趾内收，手脚近端指腹饱满，足外翻 不追视 喂养困难 是目前较为成熟的遗传性疾病诊断技术 传统核型分析技术 绒毛活检取材 孕中期羊膜腔穿刺羊水 细胞培养 染色体核型分析 染色体数量变化、平衡、不平衡易位、转位和显微镜下 可见的大片段缺失和重复。 核型分析局限性 材料受限，需要新鲜的组织、血样进行活细胞培养 不能分辨长度在10Mb以下染色体片断的缺失、重复或易位 染色体亚端粒区域异常诊断率较低 不能检测LOH和UPD 单细胞分析 高分辨率分析 荧光原位杂交技术（fluorescent in-situ hybridization，FISH) 可对相应位点的缺失、重复、易位及多倍体等染色体异常作出诊断 提高了染色体异常的诊断精度 FISH探针能同时与分裂期染色体或间期核染色丝特异杂交----无需细胞培养，可用于单细胞分析 Chromosome 13q13-14 荧光标记的DNA探针 中期分裂相 间期细胞核 Chromosome 21q21 FISH局限性 只能检测已知突变的疾病，对背景未知的基因引发的疾病无法检测。 不能分辨LOH和UPD 一次最多只能检测5-8个位点，无法进行整个基因组的检测，增加探针又会面临准确性下降的问题。 对植入前胚胎的检测，缺乏覆盖全基因组检测的能力 微阵列比较基因组