利用小麦55K SNP芯片初定位“川中”鹅观草成株期抗条锈病基因YrK1007.pdfVIP

摘要 小麦条锈病是由小麦条锈菌（Puccinia striiformis f. sp. tritici ）引起的真菌病害， 严重威胁小麦产量。虽然化学防治取得一定成效，但是培育抗病品种是防治小麦条锈 病最安全和有效的方法。普通小麦的改良依赖于丰富的遗传多样性，而小麦育种中所 需的大多数有利遗传变异都能够由小麦族的野生近缘种作为基因源提供。鹅观草 （Roegneria kamoji Ohwi ）是禾本科小麦族鹅观草属（Roegneria C. Koch ）多年生草 本植物，六倍体（2n=6x=42 ），含StStYYHH 基因组，是普通小麦的三级基因源，其 优异的基因可拓宽小麦遗传基础，提高小麦抗病、抗逆等特性。本研究通过对“赣饲 1 号”鹅观草和“川中”鹅观草杂交构建的F2 群体及F2:3 家系进行田间抗条锈病鉴定， 利用小麦55K SNP 芯片技术，对“川中”鹅观草所携带的抗条锈病基因 YrK1007 进行 初定位，主要结果如下： 1. 鹅观草成株期鉴定结果表明：2017 年165 株F2 代群体中，120 株表现为抗病， 2 45 株表现为感病，分离比符合3R ∶1S （χ = 0.455, P = 0.500 ）。2018 年160 株F2 代 2 群体中，121 株表现为抗病，39 株表现为感病，分离比符合3R ∶1S （χ = 0.33, P = 0.855 ）。对F2:3 家系调查结果显示，全部抗病的株系有37 份，全部感病的株系有40 2 份，剩余的83 份表现出杂合型表型，符合1:2:1 分离比 （χ = 0.338, P = 0.845 ）。抗性 遗传分析表明，“川中”鹅观草的抗性由一个显性抗病基因控制，暂命名为 YrK1007。 2. 通过小麦55K SNP 芯片对165 份F2 代材料DNA 进行检测以及基因分型，一 共得到六种类型的标记数据53064 个，选取其中三种类型的标记共计10860 个用于构 建遗传图谱，剔除冗余标记后最终得到了由 1662 个标记构建的遗传连锁图谱。遗传 图谱包含三个连锁群：第一连锁群（LG1 ）总长917.22cM，含有1072 个标记；第二 连锁群（LG2 ）总长393.09cM，含有562 个标记；第三连锁群（LG3 ）总长102.41cM， 含有28 个标记。 3. 使用QTL IciMapping 软件，结合田间表型性状和遗传图谱信息进行基因定位， LOD 值阈值设置为2.5 ，结果检测出1 个位点。将鹅观草抗条锈病基因YrK1007 初步 定位于第一连锁群上标记AX-111575769 和标记AX-109554178 间遗传距离为2.3cM 片段上，LOD 值为2.56 ，解释了6.29 ％的表型变异。 4. 将 2 个连锁标记与普通小麦中国春基因组物理图谱比对，发现这两个标记位 于1D 染色体上大约320Mb 间隔区域内；与节节麦基因组物理图谱比对，发现这两个 I 标记位于1D 染色体上大约324Mb 间隔区域内，与普通小麦比对结果基本一致；与栽 培大麦基因组（H ）物理图谱比对，将2 个连锁标记定位于4H 染色体上大约8Mb 间 隔区域内。 关键词: 鹅观草；条锈病；抗性基因；SNP 芯片；分子定位 II Abstract Wheat stripe rust is a fungal disease caused by Puccinia striiformis f. sp. tritici, which seriously threatens wheat yield. Although chemical control has achieved certain effects, breeding resistant wheat var