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蛋白质结构功 Secondary structures of proteins (一).蛋白质的高级结构—空间结构 (二).蛋白质的二级结构 (三).二级结构的基本类型 (四).二级结构类型的代表性蛋白 (五).超二级结构及结构域  (一).蛋白质的高级结构——空间结构 维空间上特定的走向与排布就是蛋白质的高级结构,也 叫做空间结构。三维结构,立体结构,或叫做三维构象。  蛋白质的结构层次 一级结构,指蛋白质分子中的氨基酸的排列顺序。 二级结构,指蛋白质多肽链的主链骨架中的若干肽段的构象 排列。所有蛋白质的主链结构相同,长短不同。 三级结构,指多肽链在二级结构的基础上,各原子的空间排布, 包括侧链基团的取向,是二级结构的基础上范围更 广的盘旋和折叠。 四级结构,是指多条肽链组成的一个蛋白质分子时,各亚单位 在寡聚蛋白质中空间排布及亚单位间的相互作用。  (二).蛋白质的二级结构 肽单位( The peptide group) 构成肽链主链的基本单元,叫做肽单位——主 链骨架重复单位,它包括两个α-碳原子及其中间的 个肽键,Ca- CO-NH-Co,肽单位又叫肽平面。 N c→C  面角( The dihedral angles) Ca-N键的旋转角度叫φ角, Amide Ca-C的旋转角度叫ψ角。 q角,ψ角叫做二面角, 二面角易受空间障碍的 限制。 =180°,v=180  2、二面角( The dihedral angles) ●当Φ(H)旋转键两侧 的主链呈顺式时, 规定Φ()=0 从Cα沿键轴方向看, 顺时针旋转的Φ() 角为正值,反之为 负值  3、可允许的Φ和屮值 拉氏构象图( Ramachandran diagram) +180 Ramachandran根据蛋白 120 没允许区 质中非键合原子间的最小 60最大允许区 接触距离,确定了哪些成 对二面角(φ、屮)所规 定的两个相邻肽单位的构 不允许区象是允许的,哪些是不允 许的,并且以Φ为横坐标 180 180 180以甲为纵坐标,在坐标图 上标出,该坐标图称拉氏 以Aa为例 构象图。  (三).蛋白质二级结构的基本类型 1、∞x-螺旋(α- helix) 1)α-螺旋构象的结构特点 。Q  3 3 氢键 54A 氢键 ●o  级结构( Secondary structure) Linus Pauling(Caltech) ● a Helix:螺旋 (1) Right handed(右手旋) (2)每36氨基酸绕一圈,每圈54A高 (3) Carbonyl(C=○)与下游HN形成氢键 (4)每个氢键以13个原子夹着(a13) 5)整个αhel呈圆筒状,且有偶极性 Juang RH(2004)BCbaiscs