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现代分子生物学
基因组(genome)的定义:生物体遗传信息的全部序列,它包括每一条染色体和任何亚细胞器的DNA的序列
基因组学(genomics)发展和应用DNA制图、测序新技术以及计算机程序,分析生命体(包括人类)全部基因组结构及功能的科学。
3、基因组学包括3个主要的领域
结构基因组学(structural genomics)
功能基因组学(functional genomics)
比较基因组学(comparative genomics)
4、结构基因组学:指整个基因组的遗传制图、物理制图及DNA测序
5、功能基因组学:是指在全基因组序列测定的基础上,从整体基因水平研究基因及其产物在不同时间、空间、条件的结构与功能的关系及活动规律的学科
6、比较基因组学:比较基因组学(comparative genomics)涉及比较不同物种的整个基因组,以便深入理解每个基因组的功能和进化关系的基因组学。
7、第一代多态性遗传标记是RFLP(restriction fragment length polymorphism,限制性片段长度多态性)
8、第二代多态性遗传标记是短的串联重复序列
包括小卫星DNA和微卫星DNA,其多态性主要来自重复序列拷贝数的变化
9、第三代多态性遗传标记是单核苷酸的多态性
(single nucleotide polymorphism,SNP)
10、遗传图:又称为连锁图,是指基因或DNA标志在染色体上的相对位置和遗传距离。
11、物理图:以已知核苷酸序列的DNA片段(序列标签位点,sequence-tagged site, STS)为“路标”,以碱基对作为基本测量单位(图距)的基因组图。
12、转录图:以EST(expressed sequence tag ,表达序列标签)为标记,根据转录顺序的位置和距离绘制的图谱。
13、全序列图:序列图是指整个人类基因组的核苷酸序列图,也是最详尽的物理图。
14、STS与ETS的关系:EST是mRNA互补的cDNA,称为表达序列标签,
STS 是对EST进行大规模测序后得到的单一序列
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