分子生物学-16-1-基因组与比较基因组学.docVIP

PAGE 郜刚分子生物学教案 教学单元教案格式 第11章 基因组与比较基因组学 课程教案 授课题目：第11章 基因组与比较基因组学 教学时数： 2 授课类型： eq \o\ac(□,√) 理论课 □ 实践课 教学目的、要求： 1.掌握基因组及基因组学的基本概念； 2.了解基因组学分支学科的定义以及主要研究内容； 功能基因组 比较基因组 3.掌握人类基因组计划的四张图含义、目的 教学重点： 教学重点：人类基因组计划的四张图， 授课难点：物理图的构建 了解最近完成的基因组计划有哪些？ 主要内容 一 基因组 二 基因组学 三 HGP目的、意义、内容、策略、结果 四 其他基因组 五 比较基因组 教学方法和手段： 老师讲授为主：讲授 视频演示 PPT演示 讨论。以电脑幻灯片边演示边讲述为主，（白板课件）辅以板书（黑板板书） 学生回答问题为辅：（如时间等条件许可的情况下） 注：以下内容按实际需要进行取舍 要求有多媒体，因为信息量大，许多结构图需要媒体放映，效果才好 教学内容与教学设计： 教学设计 本章开篇以分析史料为主，阐述了人类基因组计划研究的发展过程极其重大意义，之后简述了DNA测序技术和DNA文库的构建，这部内容与前面第五章有部分重复，因此实际授课中将这部分内容放在第五章，这里不再赘述。而基因组测序的策略是宏观上将一个完整基因组测序策略的，放在后续人类基因组计划阐述中降解，有利于学生的识记和理解。 而“组学”的出现是人类基因组计划的产物或者衍生物，这是目前学科的发展热点，从授课技巧上，将这部分内容放在最前面，以热点引导，先全面概述，后重点降解，既可以构建学生知识体系的基本框架，又可以突出重点。 11.1 基因组学概念及范畴 基因组(genome)是德国遗传学家H. Winkler在1920年将gene（基因）和chromosome(染色体)两个词缩合而创造的一个新词，意思是指染色体上的全部基因。 含义扩展：在个体水平代表一个个体所有遗传性状的总和，在细胞水平代表一个细胞所有不同染色体（单倍体）的总和，在分子水平代表一个物种所有DNA分子的总和。 基因组(genome)的定义： 生物体遗传信息的全部序列，它包括每一条染色体和任何亚细胞器的DNA的序列。 原核生物基因组： 原核生物DNA分布在整个细胞之中，有时相对集中在类核体上。类核体上的DNA是一条共价、闭合双链分子，类核体通常也称为染色体。 原核细胞都是单倍的。原核生物中一般只有一条染色体。这条染色体的DNA就是原核细胞的基因组。 真核生物基因组 一个物种的单倍体的各条染色体中的全部DNA为该物种的基因组(genome)。 真核生物基因组的主要成分被核膜所包裹，与细胞质分开。 基因组学(genomics) 发展和应用DNA制图、测序新技术以及计算机程序，分析生命体（包括人类）全部基因组结构及功能的科学。 由美国科学家Thomas Roderick于1986年首创 基因组学发展小史 1980年，噬菌体（5,368 碱基对）完全测序，成为第一个测定的基因组。 1990年，人类基因组计划开始实施。 2000年，人类基因组草图完成。 2003年，人类基因组计划完成。 目前，已完成基因组测序的模式生物包括小鼠，果蝇，酵母等。 基因组学发展趋势 基因转录及其调控的研究 解析控制整个发育过程或反应通路的基因表达网络。 蛋白质组学研究 从整体上研究蛋白质的水平和修饰状态。 研究蛋白质之间的相互关系。 基因组多样性的研究 对人类DNA的再测序 对其它生物的测序 基因组学包括3个主要的领域 结构基因组学(structural genomics) 功能基因组学(functional genomics) 比较基因组学(comparative genomics) 基因组学包括多个不同的亚领域 结构基因组学 最初是指整个基因组的遗传制图、物理制图及DNA测序，如今是一门用结构生物学方法研究整个生物体、整个细胞或整个基因组中所有的蛋白质和相关蛋白质复合物的三维结构的学科。 主要利用实验方式（X射线晶体学、核磁共振谱学和电子显微学）来测定蛋白质结构，同时结合同源建模（homology modelling）这一计算方式来推测蛋白质结构。 和传统结构生物学不同的是，利用结构基因组学所测定的蛋白质结构通常是功能未知的蛋白质。 这令科学家创立了结构生物信息学，利用三维结构信息来预测蛋白质功能。 结构基因组学重视快速、高通量（high throughput）的蛋白质结构测定，而同步辐射装置是实现这一目标的重要实验装